More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3059 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3059  putative zinc protease  100 
 
 
427 aa  869    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3547  peptidase M16 domain protein  50.12 
 
 
432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3613  peptidase M16 domain protein  50.12 
 
 
438 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3360  M16 family peptidase  46.56 
 
 
439 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0031  peptidase M16 domain-containing protein  48.94 
 
 
430 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.652057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0052  peptidase M16-like  45.48 
 
 
432 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.430773 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3238  peptidase M16 domain-containing protein  44.39 
 
 
431 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3616  peptidase M16 domain protein  44.23 
 
 
425 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0619  peptidase M16 domain-containing protein  37.91 
 
 
474 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0576  peptidase M16-like  38.97 
 
 
473 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0611  peptidase M16 domain protein  38.97 
 
 
473 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0603  peptidase M16 domain protein  38.97 
 
 
473 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0281  peptidase M16 domain protein  33.49 
 
 
440 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  32.44 
 
 
419 aa  206  7e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  31.78 
 
 
419 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0127  peptidase M16 domain-containing protein  34.05 
 
 
466 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  32.45 
 
 
421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  31.76 
 
 
419 aa  199  9e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  30.51 
 
 
422 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  31.31 
 
 
422 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  30.14 
 
 
423 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3233  peptidase M16 domain protein  31.72 
 
 
426 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  29.06 
 
 
424 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  30.2 
 
 
413 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  29.97 
 
 
413 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2222  peptidase M16 domain protein  33.25 
 
 
451 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000128075  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  32.46 
 
 
438 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  28.57 
 
 
422 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  26.88 
 
 
411 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1562  Zn-dependent peptidase  28.4 
 
 
419 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000390885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  30.12 
 
 
418 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1594  M16 family peptidase  27.86 
 
 
418 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.326709  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  29.51 
 
 
420 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0910  processing peptidase  27.14 
 
 
422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  28.26 
 
 
424 aa  167  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  29.41 
 
 
412 aa  166  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  28.68 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  28.92 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  31.41 
 
 
462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  28.92 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  28.92 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1637  processing peptidase  25.69 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  28.92 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  28.92 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  30.94 
 
 
466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  28.92 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0397  peptidase M16 domain-containing protein  29.55 
 
 
431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1190  peptidase M16 domain-containing protein  31.25 
 
 
477 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0547363  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  28.68 
 
 
413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  28.4 
 
 
418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  30.6 
 
 
467 aa  163  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  31.1 
 
 
441 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  28.68 
 
 
413 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7875  processing peptidase  30.83 
 
 
439 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  26.37 
 
 
419 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  26.51 
 
 
425 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1147  peptidase M16 domain-containing protein  29.51 
 
 
431 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  27.58 
 
 
417 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  26.92 
 
 
418 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  28.24 
 
 
423 aa  158  1e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  26.44 
 
 
418 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1507  peptidase M16 domain-containing protein  29.16 
 
 
451 aa  159  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.583967  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0621  processing peptidase  30.02 
 
 
419 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  28.97 
 
 
421 aa  158  2e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  30.73 
 
 
436 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  30.9 
 
 
418 aa  156  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0785  mitochondrial processing peptidase  29.88 
 
 
462 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3148  processing peptidase  34.21 
 
 
419 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3953  peptidase M16 domain protein  32.6 
 
 
459 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870658  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  31.38 
 
 
435 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2477  peptidase M16 domain protein  30.57 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424609  normal  0.386088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12795  zinc protease pepR  31.12 
 
 
438 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  27.92 
 
 
399 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1832  M16 family peptidase  28.64 
 
 
419 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1467  peptidase M16 domain protein  29.22 
 
 
457 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0481  processing peptidase  28.87 
 
 
419 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  29.25 
 
 
421 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3582  peptidase M16 domain protein  29.43 
 
 
444 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1435  peptidase M16 domain-containing protein  28.57 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  29.22 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  28.99 
 
 
421 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  28.85 
 
 
429 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  29.71 
 
 
424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0235  M16 family peptidase  26.72 
 
 
421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1235  processing peptidase  27.74 
 
 
418 aa  147  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1440  peptidase M16 domain protein  28.94 
 
 
447 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2351  peptidase M16 domain-containing protein  29.38 
 
 
451 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3176  peptidase M16 domain-containing protein  29.37 
 
 
453 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  28.71 
 
 
429 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  28.71 
 
 
429 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1414  processing peptidase  28.88 
 
 
410 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.186097 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  28.71 
 
 
429 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1739  peptidase M16 domain protein  29.5 
 
 
443 aa  143  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2117  processing peptidase  27.03 
 
 
429 aa  143  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1147  processing peptidase  28.43 
 
 
426 aa  143  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2329  peptidase  28.07 
 
 
420 aa  142  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124129  normal  0.969107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07110  predicted Zn-dependent peptidase  29.72 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.54818  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1218  peptidase M16 domain protein  28.61 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.37886  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  28.05 
 
 
429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1907  peptidase M16 domain-containing protein  25.06 
 
 
419 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0978353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>