More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3613 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3613  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
438 aa  900    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3547  peptidase M16 domain protein  96.99 
 
 
432 aa  860    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0031  peptidase M16 domain-containing protein  68.53 
 
 
430 aa  592  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.652057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0052  peptidase M16-like  63.68 
 
 
432 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.430773 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3360  M16 family peptidase  61.08 
 
 
439 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3238  peptidase M16 domain-containing protein  53.92 
 
 
431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3616  peptidase M16 domain protein  49.17 
 
 
425 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3059  putative zinc protease  48.95 
 
 
427 aa  364  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0619  peptidase M16 domain-containing protein  31.21 
 
 
474 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0611  peptidase M16 domain protein  31.44 
 
 
473 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0603  peptidase M16 domain protein  31.44 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0576  peptidase M16-like  31.19 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0281  peptidase M16 domain protein  30.52 
 
 
440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0127  peptidase M16 domain-containing protein  31.8 
 
 
466 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  33.33 
 
 
419 aa  206  7e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  31.88 
 
 
422 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  32.61 
 
 
419 aa  205  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  32.13 
 
 
421 aa  200  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  31.55 
 
 
419 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  32.83 
 
 
413 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  32.04 
 
 
413 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0910  processing peptidase  29.58 
 
 
422 aa  194  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  29.88 
 
 
422 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  31.55 
 
 
420 aa  190  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  30.56 
 
 
412 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  30.07 
 
 
413 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  30.07 
 
 
413 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  30.07 
 
 
413 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  30.07 
 
 
413 aa  189  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  30.07 
 
 
413 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  30.07 
 
 
413 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  30.07 
 
 
413 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  29.83 
 
 
413 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3233  peptidase M16 domain protein  30.86 
 
 
426 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  28.74 
 
 
411 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  31.72 
 
 
429 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  29.83 
 
 
413 aa  187  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  29.91 
 
 
424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  30.14 
 
 
424 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3176  peptidase M16 domain-containing protein  30.6 
 
 
453 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0840  putative zinc protease  33.17 
 
 
429 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  31.26 
 
 
438 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  32.54 
 
 
429 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  29.26 
 
 
425 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  30.4 
 
 
418 aa  179  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1637  processing peptidase  27.92 
 
 
418 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  30.03 
 
 
399 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  28.74 
 
 
422 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  29.18 
 
 
418 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0488  zinc protease  32.77 
 
 
430 aa  176  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0964093  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4796  peptidase M16-like  32.37 
 
 
429 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  30.75 
 
 
441 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  30.62 
 
 
462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  29.67 
 
 
466 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0263  peptidase M16-like  31.82 
 
 
429 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.736782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0397  peptidase M16 domain-containing protein  27.65 
 
 
431 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0483  processing protease  32.28 
 
 
430 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.678653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  28.27 
 
 
423 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0823  peptidase M16-like  31.96 
 
 
429 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  28.54 
 
 
419 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3953  peptidase M16 domain protein  30.62 
 
 
459 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870658  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0230  peptidase M16  31.67 
 
 
429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1419  peptidase M16-like protein  29.58 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0503674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1147  peptidase M16 domain-containing protein  28.81 
 
 
431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  29.68 
 
 
434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  31.28 
 
 
436 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  30 
 
 
421 aa  166  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1435  peptidase M16 domain-containing protein  30.38 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  32.13 
 
 
434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  28.74 
 
 
467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1594  M16 family peptidase  29.41 
 
 
418 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.326709  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0598  processing peptidase  31.65 
 
 
430 aa  163  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1507  peptidase M16 domain-containing protein  30.05 
 
 
451 aa  163  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.583967  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  28.77 
 
 
429 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  28.77 
 
 
429 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  28.77 
 
 
429 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  28.61 
 
 
421 aa  162  1e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0621  processing peptidase  30.12 
 
 
419 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12795  zinc protease pepR  29.84 
 
 
438 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  29.45 
 
 
435 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1218  peptidase M16 domain protein  29.15 
 
 
442 aa  160  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.37886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2222  peptidase M16 domain protein  28.88 
 
 
451 aa  160  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000128075  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0481  processing peptidase  30.51 
 
 
419 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  27.74 
 
 
418 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  28.17 
 
 
418 aa  159  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2477  peptidase M16 domain protein  29.38 
 
 
445 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424609  normal  0.386088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7875  processing peptidase  31.81 
 
 
439 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23370  predicted Zn-dependent peptidase  29.05 
 
 
441 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0226628 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1519  peptidase M16 domain protein  30.32 
 
 
441 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1832  M16 family peptidase  30.27 
 
 
419 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  29.94 
 
 
423 aa  157  4e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  30.6 
 
 
421 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1440  peptidase M16 domain protein  29.88 
 
 
447 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3753  peptidase M16 domain-containing protein  28.03 
 
 
455 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07110  predicted Zn-dependent peptidase  28.19 
 
 
439 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.54818  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0691  peptidase M16 domain protein  30.8 
 
 
432 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  27.54 
 
 
453 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1026  processing peptidase  29.41 
 
 
439 aa  155  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3582  peptidase M16 domain protein  30.38 
 
 
444 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0678  peptidase M16 domain-containing protein  30.22 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.614007  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>