81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1429 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1429  adenylylsulfate reductase, beta subunit  100 
 
 		 160 aa  332  9e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0667078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1234  adenylylsulfate reductase, beta subunit  84.18 
 
 		 164 aa  288  2e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.480788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  47.89 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  46.85 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  46.15 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0272  adenylylsulfate reductase, beta subunit  51.33 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000000553885  hitchhiker  0.000000190129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0997  adenylylsulfate reductase, beta subunit  45.19 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000160425  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2130  adenylylsulfate reductase, beta subunit  44.03 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.925917  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1109  adenylylsulfate reductase subunit beta  44.78 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000257152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2892  adenylylsulfate reductase, beta subunit  44.78 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.409396 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2137  adenylylsulfate reductase, beta subunit  44.78 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3578  adenylylsulfate reductase, beta subunit  40.82 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000448806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0636  adenylylsulfate reductase, beta subunit  42.57 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1967  adenylylsulfate reductase, beta subunit  42.67 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0419652 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1838  adenylylsulfate reductase, beta subunit  39.46 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0138336  normal  0.023497 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1886  adenylylsulfate reductase, beta subunit  40.54 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3197  adenylylsulfate reductase, beta subunit  42.18 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000312858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1081  adenylylsulfate reductase, beta subunit  40.44 
 
 		 147 aa  101  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1047  adenylylsulfate reductase, beta subunit  40.14 
 
 		 147 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0187678  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0040  adenylylsulfate reductase, beta subunit  38.1 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1586  adenylylsulfate reductase subunit beta  39.73 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00926364  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0873  adenylylsulfate reductase, beta subunit  32.92 
 
 		 161 aa  90.5  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0925  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.3 
 
 		 113 aa  51.2  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  38.6 
 
 		 634 aa  50.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.84 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2390  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin) alpha and beta subunits-like  33.33 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000111443  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0877  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.99 
 
 		 995 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  32.73 
 
 		 255 aa  45.1  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  38.6 
 
 		 385 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0879  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 381 aa  44.7  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 257 aa  44.7  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.448706 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.07 
 
 		 118 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.910611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  40 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3162  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48 
 
 		 81 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1904  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34 
 
 		 228 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 368 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.07 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2383  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0553  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  39.68 
 
 		 436 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.238228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5012  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.94 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07910  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  30.3 
 
 		 447 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.85 
 
 		 995 aa  43.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.573197  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0206  ferredoxin, 4Fe-4S  46.94 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.623695 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.4 
 
 		 367 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0278  hypothetical protein  36.21 
 
 		 268 aa  43.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.09 
 
 		 305 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34920  putative ferredoxin  46 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0985  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.31 
 
 		 356 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  35.85 
 
 		 624 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0517  ferredoxin  31.51 
 
 		 295 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1243  ferredoxin  34.92 
 
 		 303 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.49 
 
 		 107 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 557 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.18 
 
 		 421 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1786  ferredoxin  32.84 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  38.78 
 
 		 598 aa  42  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0134  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.09 
 
 		 161 aa  42  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2470  ferredoxin, 4Fe-4S  33.75 
 
 		 107 aa  42  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1777  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.46 
 
 		 369 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1425  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  32.43 
 
 		 810 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0494363  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  39.62 
 
 		 624 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.42 
 
 		 292 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1047  ferredoxin  31.34 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.87 
 
 		 1126 aa  41.2  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 658 aa  41.2  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 367 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  37.25 
 
 		 590 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3013  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 1006 aa  40.8  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.672431  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 1006 aa  40.8  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  31.33 
 
 		 502 aa  40.8  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1811  ferredoxin  38.46 
 
 		 64 aa  40.8  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0372  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38 
 
 		 418 aa  40.8  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.69 
 
 		 291 aa  40.8  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1173  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 990 aa  40.8  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.461948 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0559  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.62 
 
 		 352 aa  40.4  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1410  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.59 
 
 		 56 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000386178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.33 
 
 		 107 aa  40.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456282  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.94 
 
 		 427 aa  40.4  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1453  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.18 
 
 		 1067 aa  40.4  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.551419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  32.31 
 
 		 322 aa  40.4  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>