91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1234 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1234  adenylylsulfate reductase, beta subunit  100 
 
 
164 aa  342  1e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.480788  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1429  adenylylsulfate reductase, beta subunit  84.18 
 
 
160 aa  288  2e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0667078 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  50 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  50.35 
 
 
160 aa  137  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  48.95 
 
 
160 aa  131  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0272  adenylylsulfate reductase, beta subunit  50.44 
 
 
161 aa  122  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000000553885  hitchhiker  0.000000190129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1109  adenylylsulfate reductase subunit beta  44.44 
 
 
162 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000257152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2137  adenylylsulfate reductase, beta subunit  42.11 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2892  adenylylsulfate reductase, beta subunit  44.78 
 
 
167 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.409396 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2130  adenylylsulfate reductase, beta subunit  43.28 
 
 
162 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.925917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1967  adenylylsulfate reductase, beta subunit  44.78 
 
 
167 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0419652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3197  adenylylsulfate reductase, beta subunit  40.13 
 
 
162 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000312858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1081  adenylylsulfate reductase, beta subunit  37.58 
 
 
147 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0636  adenylylsulfate reductase, beta subunit  41.1 
 
 
147 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1047  adenylylsulfate reductase, beta subunit  38.93 
 
 
147 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0187678  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0997  adenylylsulfate reductase, beta subunit  41.48 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000160425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3578  adenylylsulfate reductase, beta subunit  42.42 
 
 
146 aa  98.6  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000448806  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1886  adenylylsulfate reductase, beta subunit  39.01 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1838  adenylylsulfate reductase, beta subunit  42.28 
 
 
140 aa  95.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0138336  normal  0.023497 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1586  adenylylsulfate reductase subunit beta  41.8 
 
 
140 aa  92  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00926364  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0040  adenylylsulfate reductase, beta subunit  43.36 
 
 
140 aa  91.7  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0873  adenylylsulfate reductase, beta subunit  39.5 
 
 
161 aa  87.4  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0925  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.25 
 
 
113 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0014  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.1 
 
 
1116 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.952368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.91 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 
368 aa  46.6  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.910611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.58 
 
 
292 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.85 
 
 
103 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0553  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  38.1 
 
 
436 aa  45.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.238228  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.89 
 
 
257 aa  44.7  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.448706 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0278  hypothetical protein  36.36 
 
 
268 aa  44.7  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  36.84 
 
 
322 aa  44.7  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0877  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.62 
 
 
995 aa  44.3  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1425  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  33.78 
 
 
810 aa  44.3  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0494363  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2390  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin) alpha and beta subunits-like  34.29 
 
 
215 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000111443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.09 
 
 
305 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.48 
 
 
427 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3162  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.06 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274063  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  31.67 
 
 
255 aa  43.9  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3264  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.21 
 
 
697 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0985  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.27 
 
 
356 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
557 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0418  response regulator receiver protein  32.43 
 
 
1142 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.718645  normal  0.455985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1904  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32 
 
 
228 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083594  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.21 
 
 
105 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.21 
 
 
710 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241715  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0134  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.09 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.42 
 
 
1126 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0309  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
260 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.69 
 
 
535 aa  42.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.07 
 
 
437 aa  42.4  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  33.93 
 
 
634 aa  42.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0934  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.67 
 
 
695 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0372  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
418 aa  42.4  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.29 
 
 
92 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0826775  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.54 
 
 
421 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.73 
 
 
291 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5012  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.94 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34920  putative ferredoxin  47.17 
 
 
81 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025951  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0206  ferredoxin, 4Fe-4S  46.94 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.623695 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.8 
 
 
368 aa  42  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0449  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.41 
 
 
665 aa  41.6  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222499  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  39.34 
 
 
60 aa  41.6  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3715  glycyl-radical enzyme activating protein family  32.08 
 
 
316 aa  41.6  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.07 
 
 
107 aa  41.6  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.38 
 
 
170 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.12789  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0139  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  31.51 
 
 
428 aa  41.6  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.668002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35 
 
 
426 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964993  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  36.36 
 
 
385 aa  41.6  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1184  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.78 
 
 
97 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.68406  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1173  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.26 
 
 
990 aa  41.2  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.461948 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30 
 
 
687 aa  41.2  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2823  electron transport complex, B subunit  34.43 
 
 
182 aa  41.2  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30 
 
 
699 aa  41.2  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0324842  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.26 
 
 
658 aa  40.8  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1265  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
58 aa  41.2  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.755601  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1285  iron-sulfur cluster-binding domain protein, putative ferridoxin  36.73 
 
 
550 aa  40.8  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1568  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.84 
 
 
58 aa  40.8  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2383  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.43 
 
 
92 aa  40.8  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1977  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
1021 aa  40.8  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1706  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.32 
 
 
68 aa  40.8  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0164  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  33.33 
 
 
591 aa  40.8  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  34.55 
 
 
635 aa  40.8  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07910  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  30.3 
 
 
447 aa  40.8  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0213  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  36.17 
 
 
547 aa  40.4  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21920  4Fe-4S ferredoxin protein  32.79 
 
 
130 aa  40.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1047  ferredoxin  28.4 
 
 
170 aa  40.4  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2408  radical activating enzyme  34.69 
 
 
286 aa  40.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1412  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.92 
 
 
182 aa  40.4  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.998302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>