34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0873 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0873  adenylylsulfate reductase, beta subunit  100 
 
 		 161 aa  337  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1586  adenylylsulfate reductase subunit beta  69.78 
 
 		 140 aa  206  7e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00926364  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0040  adenylylsulfate reductase, beta subunit  69.78 
 
 		 140 aa  205  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1838  adenylylsulfate reductase, beta subunit  69.78 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0138336  normal  0.023497 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2137  adenylylsulfate reductase, beta subunit  67.61 
 
 		 167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2892  adenylylsulfate reductase, beta subunit  67.61 
 
 		 167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.409396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1109  adenylylsulfate reductase subunit beta  64.83 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000257152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1047  adenylylsulfate reductase, beta subunit  70.73 
 
 		 147 aa  192  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0187678  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1967  adenylylsulfate reductase, beta subunit  66.19 
 
 		 167 aa  187  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0419652 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2130  adenylylsulfate reductase, beta subunit  68.8 
 
 		 162 aa  184  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.925917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0636  adenylylsulfate reductase, beta subunit  64.03 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3197  adenylylsulfate reductase, beta subunit  62.68 
 
 		 162 aa  182  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000312858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0997  adenylylsulfate reductase, beta subunit  59.03 
 
 		 144 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000160425  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1886  adenylylsulfate reductase, beta subunit  67.48 
 
 		 145 aa  178  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1081  adenylylsulfate reductase, beta subunit  58.9 
 
 		 147 aa  177  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3578  adenylylsulfate reductase, beta subunit  59.46 
 
 		 146 aa  177  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000448806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0272  adenylylsulfate reductase, beta subunit  48.33 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000000553885  hitchhiker  0.000000190129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  44.85 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  44.53 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  43.8 
 
 		 160 aa  98.2  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1429  adenylylsulfate reductase, beta subunit  32.92 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0667078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1234  adenylylsulfate reductase, beta subunit  39.5 
 
 		 164 aa  87.4  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.480788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.82 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.85 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000841156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0925  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.64 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1709  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  34.23 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.91 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.07 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  30.99 
 
 		 318 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.79 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1811  ferredoxin  42 
 
 		 64 aa  41.2  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.22 
 
 		 1480 aa  41.2  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7631  ferredoxin  31.43 
 
 		 101 aa  41.2  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295898  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  34.72 
 
 		 60 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>