41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1586 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1586  adenylylsulfate reductase subunit beta  100 
 
 		 140 aa  293  7e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00926364  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0040  adenylylsulfate reductase, beta subunit  95 
 
 		 140 aa  282  8e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1838  adenylylsulfate reductase, beta subunit  94.29 
 
 		 140 aa  280  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0138336  normal  0.023497 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0873  adenylylsulfate reductase, beta subunit  69.78 
 
 		 161 aa  206  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1047  adenylylsulfate reductase, beta subunit  72.65 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0187678  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1967  adenylylsulfate reductase, beta subunit  66.19 
 
 		 167 aa  193  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0419652 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1109  adenylylsulfate reductase subunit beta  65.44 
 
 		 162 aa  192  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000257152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3578  adenylylsulfate reductase, beta subunit  61.64 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000448806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0636  adenylylsulfate reductase, beta subunit  72.65 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0997  adenylylsulfate reductase, beta subunit  73.04 
 
 		 144 aa  190  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000160425  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3197  adenylylsulfate reductase, beta subunit  64.75 
 
 		 162 aa  188  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000312858  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2137  adenylylsulfate reductase, beta subunit  70 
 
 		 167 aa  187  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2892  adenylylsulfate reductase, beta subunit  70 
 
 		 167 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.409396 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2130  adenylylsulfate reductase, beta subunit  69.17 
 
 		 162 aa  184  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.925917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1886  adenylylsulfate reductase, beta subunit  69.23 
 
 		 145 aa  184  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1081  adenylylsulfate reductase, beta subunit  67.52 
 
 		 147 aa  177  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0272  adenylylsulfate reductase, beta subunit  49.15 
 
 		 161 aa  114  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000000553885  hitchhiker  0.000000190129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  45 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  43.97 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  43.97 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1429  adenylylsulfate reductase, beta subunit  39.73 
 
 		 160 aa  98.2  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0667078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1234  adenylylsulfate reductase, beta subunit  41.8 
 
 		 164 aa  92  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.480788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.19 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.19 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000841156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0925  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.66 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1709  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  34.29 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.71 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1450  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 762 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  39.68 
 
 		 319 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  38.46 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  29.7 
 
 		 500 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1265  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.755601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.1 
 
 		 81 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814234  normal  0.164928 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.65 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.68 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323948  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0528  hypothetical protein  38.46 
 
 		 57 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.625132 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  39.39 
 
 		 345 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  37.29 
 
 		 507 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>