33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1888 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 114 aa  236  8e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000841156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0925  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  60.18 
 
 		 113 aa  147  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  57.69 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1709  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  50 
 
 		 118 aa  116  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.96 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0636  adenylylsulfate reductase, beta subunit  37.61 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1081  adenylylsulfate reductase, beta subunit  41 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1047  adenylylsulfate reductase, beta subunit  40 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0187678  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0997  adenylylsulfate reductase, beta subunit  36.7 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000160425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3578  adenylylsulfate reductase, beta subunit  37 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000448806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1967  adenylylsulfate reductase, beta subunit  37.96 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0419652 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2892  adenylylsulfate reductase, beta subunit  38 
 
 		 167 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.409396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1109  adenylylsulfate reductase subunit beta  38 
 
 		 162 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000257152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2130  adenylylsulfate reductase, beta subunit  38 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.925917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1886  adenylylsulfate reductase, beta subunit  35.78 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2137  adenylylsulfate reductase, beta subunit  37 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3197  adenylylsulfate reductase, beta subunit  37 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000312858  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1838  adenylylsulfate reductase, beta subunit  35 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0138336  normal  0.023497 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1586  adenylylsulfate reductase subunit beta  35.19 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00926364  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0040  adenylylsulfate reductase, beta subunit  34 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0873  adenylylsulfate reductase, beta subunit  35.85 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0272  adenylylsulfate reductase, beta subunit  34.86 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000000553885  hitchhiker  0.000000190129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  36.62 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  35.21 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  35.38 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.16 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.96 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3746  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.96 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3162  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.34 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0206  ferredoxin, 4Fe-4S  39.34 
 
 		 81 aa  40  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.623695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.14 
 
 		 77 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.969084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5012  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 81 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.14 
 
 		 77 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>