44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1237 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1237  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
143 aa  288  1e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.701456 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2098  thioesterase superfamily protein  73.85 
 
 
132 aa  202  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.19882  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0155  thioesterase superfamily protein  49.22 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  32.59 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0310  thioesterase superfamily protein  35.87 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.121979  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0175  hypothetical protein  27.48 
 
 
150 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.883072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  30.63 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1345  thioesterase-like protein  32.03 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.175488  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01931  thioesterase  27.07 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.976791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1938  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.650407 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
137 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01911  thioesterase  26.32 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  30.63 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.53 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02021  thioesterase  25.6 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0211795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0397  thioesterase superfamily protein  25.44 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.3 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.54 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4370  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.327633  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2808  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511725  hitchhiker  0.00696789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.81 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  24.19 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  26.72 
 
 
143 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  26.72 
 
 
143 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0308  thioesterase-like protein  32.56 
 
 
167 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1390  thioesterase superfamily protein  24.11 
 
 
149 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.36 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.36 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  25.53 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  21.95 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0111  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1238  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
127 aa  40  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.106775  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  26.6 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0960  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.78 
 
 
126 aa  40  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>