33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0988 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0988  30S ribosomal protein S19e  100 
 
 		 158 aa  316  7.999999999999999e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0440  30S ribosomal protein S19e  87.97 
 
 		 158 aa  290  7e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1680  30S ribosomal protein S19e  87.97 
 
 		 158 aa  289  1e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1790  30S ribosomal protein S19e  87.97 
 
 		 158 aa  283  5e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0495408 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1926  30S ribosomal protein S19e  61.97 
 
 		 151 aa  197  5e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0470  30S ribosomal protein S19e  55.13 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0118  30S ribosomal protein S19e  51.97 
 
 		 149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1973  30S ribosomal protein S19e  47.37 
 
 		 149 aa  153  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0024  Ribosomal protein S19e  49.67 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1572  30S ribosomal protein S19e  48.03 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3015  30S ribosomal protein S19e  50.35 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0454  30S ribosomal protein S19e  48.03 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.393602  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1327  Ribosomal protein S19e  50.32 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1483  30S ribosomal protein S19e  45.39 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000000838671  hitchhiker  0.000557013 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0997  30S ribosomal protein S19e  45.39 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1624  30S ribosomal protein S19e  42.86 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0535  30S ribosomal protein S19e  48.89 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00000147139  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1887  30S ribosomal protein S19e  45.65 
 
 		 199 aa  128  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.3586 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1156  30S ribosomal protein S19e  47.59 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0794  30S ribosomal protein S19e  47.59 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.444721  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1624  30S ribosomal protein S19e  45.22 
 
 		 156 aa  127  8.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000048808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1161  30S ribosomal protein S19e  48.95 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1519  30S ribosomal protein S19e  46.9 
 
 		 141 aa  124  7e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.903507  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1299  Ribosomal protein S19e  43.23 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1981  30S ribosomal protein S19e  39.35 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3485  Ribosomal protein S19e  42.04 
 
 		 151 aa  110  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1516  Ribosomal protein S19e  41.03 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.888465  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2312  30S ribosomal protein S19e  38.06 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44019  Ribosomal protein S19, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  41.73 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.803034 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51066  predicted protein  41.61 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04060  40S ribosomal protein S19 (S16) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27073]  39.42 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0245853 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85487  predicted protein  35.92 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0629752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06100  ribosomal protein S19, putative  32.37 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>