33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1887 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1887  30S ribosomal protein S19e  100 
 
 		 199 aa  394  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.3586 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0535  30S ribosomal protein S19e  78.99 
 
 		 148 aa  236  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00000147139  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1973  30S ribosomal protein S19e  67.67 
 
 		 149 aa  206  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3015  30S ribosomal protein S19e  69.63 
 
 		 140 aa  202  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1483  30S ribosomal protein S19e  64.44 
 
 		 149 aa  190  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000000838671  hitchhiker  0.000557013 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0118  30S ribosomal protein S19e  54.73 
 
 		 149 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1572  30S ribosomal protein S19e  59.56 
 
 		 149 aa  168  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0454  30S ribosomal protein S19e  57.04 
 
 		 149 aa  166  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.393602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0997  30S ribosomal protein S19e  52.9 
 
 		 148 aa  157  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1519  30S ribosomal protein S19e  53.68 
 
 		 141 aa  156  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.903507  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0794  30S ribosomal protein S19e  52.94 
 
 		 141 aa  156  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.444721  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1156  30S ribosomal protein S19e  52.94 
 
 		 141 aa  156  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1161  30S ribosomal protein S19e  54.41 
 
 		 141 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0024  Ribosomal protein S19e  51.47 
 
 		 150 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0470  30S ribosomal protein S19e  45.99 
 
 		 163 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0440  30S ribosomal protein S19e  44.2 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0988  30S ribosomal protein S19e  44.93 
 
 		 158 aa  129  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1790  30S ribosomal protein S19e  44.2 
 
 		 158 aa  129  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0495408 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1680  30S ribosomal protein S19e  43.48 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1926  30S ribosomal protein S19e  43.88 
 
 		 151 aa  125  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1981  30S ribosomal protein S19e  43.71 
 
 		 153 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1516  Ribosomal protein S19e  43.05 
 
 		 151 aa  122  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.888465  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1624  30S ribosomal protein S19e  43.8 
 
 		 150 aa  121  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1299  Ribosomal protein S19e  47.68 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3485  Ribosomal protein S19e  41.72 
 
 		 151 aa  120  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1327  Ribosomal protein S19e  44.6 
 
 		 154 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2312  30S ribosomal protein S19e  43.42 
 
 		 151 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44019  Ribosomal protein S19, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  39.55 
 
 		 147 aa  107  8.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.803034 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04060  40S ribosomal protein S19 (S16) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27073]  40.88 
 
 		 148 aa  107  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0245853 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1624  30S ribosomal protein S19e  37.76 
 
 		 156 aa  103  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000048808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51066  predicted protein  36.76 
 
 		 152 aa  97.1  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06100  ribosomal protein S19, putative  37.23 
 
 		 161 aa  95.5  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85487  predicted protein  33.81 
 
 		 144 aa  92.4  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0629752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>