33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85487 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_85487  predicted protein  100 
 
 		 144 aa  294  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0629752  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04060  40S ribosomal protein S19 (S16) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27073]  68.09 
 
 		 148 aa  192  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0245853 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06100  ribosomal protein S19, putative  60 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44019  Ribosomal protein S19, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  55.22 
 
 		 147 aa  146  9e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.803034 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51066  predicted protein  45.21 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1624  30S ribosomal protein S19e  37.96 
 
 		 150 aa  96.7  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1161  30S ribosomal protein S19e  41.3 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1572  30S ribosomal protein S19e  41.35 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1299  Ribosomal protein S19e  39.16 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1887  30S ribosomal protein S19e  33.81 
 
 		 199 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.3586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3015  30S ribosomal protein S19e  39.85 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0535  30S ribosomal protein S19e  36.09 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00000147139  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1483  30S ribosomal protein S19e  38.35 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000000838671  hitchhiker  0.000557013 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0794  30S ribosomal protein S19e  39.13 
 
 		 141 aa  90.1  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.444721  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1156  30S ribosomal protein S19e  39.13 
 
 		 141 aa  90.1  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1519  30S ribosomal protein S19e  38.97 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.903507  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1981  30S ribosomal protein S19e  35.66 
 
 		 153 aa  86.7  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1680  30S ribosomal protein S19e  37.32 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1327  Ribosomal protein S19e  32.86 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0454  30S ribosomal protein S19e  37.78 
 
 		 149 aa  84.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.393602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1973  30S ribosomal protein S19e  34.59 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0440  30S ribosomal protein S19e  37.68 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0988  30S ribosomal protein S19e  35.92 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1790  30S ribosomal protein S19e  35.86 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0495408 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0997  30S ribosomal protein S19e  33.09 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2312  30S ribosomal protein S19e  33.57 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0118  30S ribosomal protein S19e  35.11 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1516  Ribosomal protein S19e  34.97 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.888465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3485  Ribosomal protein S19e  34.97 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0024  Ribosomal protein S19e  34.53 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1624  30S ribosomal protein S19e  26.76 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000048808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0470  30S ribosomal protein S19e  33.58 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1926  30S ribosomal protein S19e  29.58 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>