33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1327 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1327  Ribosomal protein S19e  100 
 
 		 154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1624  30S ribosomal protein S19e  63.46 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000048808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0470  30S ribosomal protein S19e  51.63 
 
 		 163 aa  150  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0794  30S ribosomal protein S19e  49.31 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.444721  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1156  30S ribosomal protein S19e  49.31 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1790  30S ribosomal protein S19e  52.9 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0495408 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0440  30S ribosomal protein S19e  50.32 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0988  30S ribosomal protein S19e  50.32 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1519  30S ribosomal protein S19e  47.92 
 
 		 141 aa  140  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.903507  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1680  30S ribosomal protein S19e  49.68 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0997  30S ribosomal protein S19e  47.37 
 
 		 148 aa  140  8e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0118  30S ribosomal protein S19e  46.05 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1926  30S ribosomal protein S19e  47.62 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1161  30S ribosomal protein S19e  46.53 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1973  30S ribosomal protein S19e  42.11 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0454  30S ribosomal protein S19e  48.03 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.393602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1483  30S ribosomal protein S19e  43.42 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000000838671  hitchhiker  0.000557013 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3015  30S ribosomal protein S19e  46.1 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0535  30S ribosomal protein S19e  43.92 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00000147139  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1887  30S ribosomal protein S19e  44.6 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.3586 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0024  Ribosomal protein S19e  44.08 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1572  30S ribosomal protein S19e  41.45 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1624  30S ribosomal protein S19e  40.41 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51066  predicted protein  40 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2312  30S ribosomal protein S19e  37.67 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3485  Ribosomal protein S19e  39.73 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1981  30S ribosomal protein S19e  36.99 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1299  Ribosomal protein S19e  37.67 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1516  Ribosomal protein S19e  38.36 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.888465  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44019  Ribosomal protein S19, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  36.03 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.803034 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85487  predicted protein  32.86 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0629752  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04060  40S ribosomal protein S19 (S16) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27073]  34.81 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0245853 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06100  ribosomal protein S19, putative  31.58 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>