33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_44019 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009365  OSTLU_44019  Ribosomal protein S19, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  100 
 
 
147 aa  303  4.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.803034 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04060  40S ribosomal protein S19 (S16) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27073]  56.06 
 
 
148 aa  150  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0245853 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85487  predicted protein  55.22 
 
 
144 aa  146  8e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0629752  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06100  ribosomal protein S19, putative  50.77 
 
 
161 aa  142  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51066  predicted protein  47.89 
 
 
152 aa  141  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1483  30S ribosomal protein S19e  39.69 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000000838671  hitchhiker  0.000557013 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0535  30S ribosomal protein S19e  39.69 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00000147139  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1887  30S ribosomal protein S19e  39.55 
 
 
199 aa  108  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.3586 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0118  30S ribosomal protein S19e  41.04 
 
 
149 aa  107  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3015  30S ribosomal protein S19e  42.22 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1973  30S ribosomal protein S19e  38.17 
 
 
149 aa  106  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1572  30S ribosomal protein S19e  42.65 
 
 
149 aa  105  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0454  30S ribosomal protein S19e  39.55 
 
 
149 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.393602  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0024  Ribosomal protein S19e  40.3 
 
 
150 aa  102  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1680  30S ribosomal protein S19e  41.73 
 
 
158 aa  100  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1790  30S ribosomal protein S19e  42.45 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0495408 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0794  30S ribosomal protein S19e  38.52 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.444721  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1156  30S ribosomal protein S19e  38.52 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0988  30S ribosomal protein S19e  41.73 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0440  30S ribosomal protein S19e  41.3 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1161  30S ribosomal protein S19e  40.3 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1519  30S ribosomal protein S19e  38.52 
 
 
141 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.903507  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0997  30S ribosomal protein S19e  39.55 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1299  Ribosomal protein S19e  40.29 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1624  30S ribosomal protein S19e  34.59 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1926  30S ribosomal protein S19e  35.77 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0470  30S ribosomal protein S19e  38.35 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1981  30S ribosomal protein S19e  37.41 
 
 
153 aa  88.6  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1327  Ribosomal protein S19e  36.03 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1624  30S ribosomal protein S19e  34.29 
 
 
156 aa  80.1  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000048808  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3485  Ribosomal protein S19e  37.41 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1516  Ribosomal protein S19e  35.97 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.888465  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2312  30S ribosomal protein S19e  34.06 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985969  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>