More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2176 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2176  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
329 aa  671    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2444  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  78.35 
 
 
328 aa  546  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2059  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  74.7 
 
 
329 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.894151  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  72.17 
 
 
330 aa  513  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  72.17 
 
 
331 aa  511  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2582  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  72.78 
 
 
329 aa  508  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.69072  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2418  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  72.26 
 
 
329 aa  497  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1268  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.31 
 
 
333 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.642063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.57 
 
 
350 aa  332  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.39 
 
 
350 aa  323  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.61 
 
 
350 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3011  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.48 
 
 
350 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000165502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.55 
 
 
348 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.24 
 
 
348 aa  315  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.79 
 
 
349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.15 
 
 
348 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.56 
 
 
340 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.13 
 
 
348 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.7 
 
 
346 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1266  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.13 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.26065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.26 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.32 
 
 
347 aa  305  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.82 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477896 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.02 
 
 
348 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.01 
 
 
353 aa  301  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.48 
 
 
345 aa  301  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000154728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.15 
 
 
340 aa  298  9e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.36 
 
 
353 aa  298  9e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.69 
 
 
336 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.39 
 
 
339 aa  296  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.55 
 
 
345 aa  295  9e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1137  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.85 
 
 
346 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.83 
 
 
346 aa  295  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.35 
 
 
356 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.95 
 
 
346 aa  291  7e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.64 
 
 
358 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.25 
 
 
351 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0202  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.09 
 
 
350 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0422268 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1255  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.8 
 
 
345 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.95 
 
 
346 aa  288  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1416  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.63 
 
 
340 aa  288  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.578384  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.12 
 
 
345 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1668  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.09 
 
 
350 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269909  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.26 
 
 
350 aa  287  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.12 
 
 
345 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.78 
 
 
350 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.71 
 
 
352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.58 
 
 
346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.06 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.35 
 
 
363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.68 
 
 
345 aa  286  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.28 
 
 
352 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0293  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.45 
 
 
346 aa  286  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.12 
 
 
346 aa  285  9e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3278  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.95 
 
 
348 aa  285  9e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2608  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.82 
 
 
345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0673  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.97 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.11 
 
 
352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.58 
 
 
349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.42 
 
 
354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3311  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.13 
 
 
351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2185  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.55 
 
 
350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.22 
 
 
358 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1447  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.63 
 
 
341 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.68 
 
 
346 aa  282  5.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2702  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.49 
 
 
345 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00227816  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.57 
 
 
354 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000206442  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1633  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.38 
 
 
352 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.55 
 
 
369 aa  282  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.68 
 
 
346 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.83 
 
 
351 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.11 
 
 
347 aa  281  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.83 
 
 
351 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1197  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.42 
 
 
354 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.07 
 
 
345 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.83 
 
 
351 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.83 
 
 
351 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.83 
 
 
351 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.51 
 
 
346 aa  280  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.5 
 
 
363 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1681  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.81 
 
 
347 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.59 
 
 
352 aa  280  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.92 
 
 
346 aa  280  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.81 
 
 
352 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.4 
 
 
331 aa  280  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.866173  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.2 
 
 
352 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294401  normal  0.678153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4053  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.2 
 
 
352 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.53 
 
 
351 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.33 
 
 
352 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0174491  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1263  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.2 
 
 
352 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.29 
 
 
379 aa  279  5e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.21 
 
 
345 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.51 
 
 
345 aa  279  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.48 
 
 
349 aa  278  6e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.51 
 
 
345 aa  278  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.15 
 
 
345 aa  278  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.15 
 
 
345 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.15 
 
 
345 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.15 
 
 
345 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  45.15 
 
 
345 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>