More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2444 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2444  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
328 aa  666    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2176  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  78.35 
 
 
329 aa  546  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  74.54 
 
 
330 aa  524  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2582  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.31 
 
 
329 aa  517  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.69072  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.01 
 
 
331 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2418  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.62 
 
 
329 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2059  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  71.95 
 
 
329 aa  501  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.894151  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1268  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.23 
 
 
333 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.642063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.73 
 
 
350 aa  333  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.9 
 
 
346 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50 
 
 
350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3011  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.54 
 
 
350 aa  324  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000165502 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.3 
 
 
350 aa  322  7e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1266  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.91 
 
 
366 aa  319  5e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.26065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.94 
 
 
344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.7 
 
 
348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.15 
 
 
348 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.85 
 
 
348 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.01 
 
 
340 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.39 
 
 
348 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.87 
 
 
346 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.59 
 
 
358 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.17 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1255  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.77 
 
 
345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.16 
 
 
347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.04 
 
 
353 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.78 
 
 
348 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.15 
 
 
350 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2608  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.11 
 
 
345 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.89 
 
 
346 aa  299  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.46 
 
 
349 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.22 
 
 
336 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.31 
 
 
349 aa  296  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.34 
 
 
340 aa  297  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.29 
 
 
356 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2702  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.46 
 
 
345 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00227816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.58 
 
 
345 aa  295  6e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000154728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.26 
 
 
350 aa  293  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.08 
 
 
339 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.27 
 
 
363 aa  292  5e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.95 
 
 
345 aa  291  7e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.49 
 
 
352 aa  291  8e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.5 
 
 
363 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.81 
 
 
352 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.63 
 
 
340 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1416  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.33 
 
 
340 aa  290  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.578384  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.95 
 
 
347 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1681  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.32 
 
 
347 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.12 
 
 
352 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.02 
 
 
346 aa  289  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.57 
 
 
346 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3278  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.2 
 
 
348 aa  286  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0293  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.06 
 
 
346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.88 
 
 
353 aa  286  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17981  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.32 
 
 
347 aa  285  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.742703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.65 
 
 
346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.58 
 
 
349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.48 
 
 
358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.98 
 
 
346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.27 
 
 
354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1137  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.09 
 
 
346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.38 
 
 
346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17811  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.41 
 
 
347 aa  282  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.13 
 
 
351 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0202  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.95 
 
 
350 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0422268 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.95 
 
 
345 aa  282  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  43.64 
 
 
359 aa  282  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.38 
 
 
350 aa  281  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1761  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.43 
 
 
350 aa  281  9e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.98 
 
 
379 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.04 
 
 
346 aa  280  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1033  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.32 
 
 
337 aa  281  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.34 
 
 
345 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.34 
 
 
346 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1197  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.81 
 
 
354 aa  280  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.95 
 
 
345 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17761  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.67 
 
 
347 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3311  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.83 
 
 
351 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1720  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.21 
 
 
368 aa  279  5e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.65 
 
 
345 aa  279  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.77 
 
 
350 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.64 
 
 
347 aa  279  6e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0673  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.76 
 
 
333 aa  278  6e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.87 
 
 
345 aa  277  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1650  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.21 
 
 
368 aa  278  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.81226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.53 
 
 
351 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.53 
 
 
351 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1668  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.04 
 
 
350 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269909  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.53 
 
 
351 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.53 
 
 
351 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.64 
 
 
347 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.53 
 
 
351 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.92 
 
 
346 aa  278  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1447  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.2 
 
 
341 aa  277  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.43 
 
 
354 aa  277  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000206442  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.87 
 
 
345 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.86 
 
 
345 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.74 
 
 
351 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.94 
 
 
345 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.6 
 
 
347 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>