More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1416 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1416  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
340 aa  687    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.578384  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1197  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  94.12 
 
 
354 aa  652    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  94.71 
 
 
354 aa  656    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.39 
 
 
346 aa  342  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.33 
 
 
350 aa  338  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.45 
 
 
336 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.62 
 
 
350 aa  326  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.03 
 
 
348 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.93 
 
 
346 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.15 
 
 
348 aa  323  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.41 
 
 
350 aa  322  6e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50 
 
 
347 aa  319  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.47 
 
 
344 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477896 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.26 
 
 
348 aa  316  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.53 
 
 
348 aa  315  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.19 
 
 
350 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.3 
 
 
350 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2184  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.8 
 
 
341 aa  314  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.85 
 
 
346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.55 
 
 
350 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.79 
 
 
346 aa  311  6.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1137  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.06 
 
 
346 aa  309  5e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.81 
 
 
355 aa  308  9e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3469  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.92 
 
 
341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1447  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50 
 
 
341 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.68 
 
 
339 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.34 
 
 
352 aa  305  9.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.15 
 
 
369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.83 
 
 
345 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000154728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.55 
 
 
349 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.4 
 
 
340 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.09 
 
 
379 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2623  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.17 
 
 
353 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.622864  normal  0.159504 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.58 
 
 
351 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113914  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.63 
 
 
331 aa  300  3e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0369  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.45 
 
 
346 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0325  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.45 
 
 
346 aa  299  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.66 
 
 
352 aa  300  4e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.21 
 
 
354 aa  299  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2858  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.58 
 
 
351 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.693195  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.41 
 
 
346 aa  299  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.63 
 
 
340 aa  299  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.13 
 
 
348 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0277  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.15 
 
 
346 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0271  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.75 
 
 
346 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1761  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.1 
 
 
350 aa  297  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0328  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.45 
 
 
346 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0283  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.45 
 
 
346 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0268  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.76 
 
 
346 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0296  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.45 
 
 
346 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.12 
 
 
351 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.65 
 
 
352 aa  296  3e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0342  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.7 
 
 
346 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.65 
 
 
363 aa  296  4e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3011  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.76 
 
 
350 aa  296  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000165502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.12 
 
 
357 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.55 
 
 
356 aa  295  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.52 
 
 
346 aa  295  7e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.76 
 
 
345 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.45 
 
 
355 aa  295  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1268  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.42 
 
 
333 aa  294  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.642063  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2487  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.43 
 
 
355 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.04 
 
 
345 aa  293  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4978  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.55 
 
 
346 aa  293  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.91 
 
 
349 aa  293  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1266  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.06 
 
 
366 aa  293  4e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.26065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.83 
 
 
351 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.83 
 
 
351 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.83 
 
 
351 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.83 
 
 
351 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0738  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.7 
 
 
354 aa  293  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.83 
 
 
351 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.09 
 
 
353 aa  293  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2059  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.42 
 
 
329 aa  292  5e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.894151  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.45 
 
 
341 aa  292  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.496619  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.88 
 
 
346 aa  292  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.05 
 
 
358 aa  292  7e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.25 
 
 
363 aa  291  9e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.32 
 
 
349 aa  291  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.85 
 
 
345 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.652409 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3311  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.54 
 
 
351 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01760  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.44 
 
 
351 aa  291  1e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.41 
 
 
349 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.429765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2444  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.33 
 
 
328 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2421  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.41 
 
 
349 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.46 
 
 
357 aa  290  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3267  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.25 
 
 
351 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.87 
 
 
340 aa  289  4e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3278  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.94 
 
 
348 aa  289  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1104  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.78 
 
 
339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.59 
 
 
355 aa  289  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2554  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.98 
 
 
341 aa  288  7e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.339877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1465  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.7 
 
 
346 aa  288  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6858  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.04 
 
 
357 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.48 
 
 
352 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.16 
 
 
349 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2176  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.63 
 
 
329 aa  288  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2418  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.38 
 
 
329 aa  287  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2582  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.48 
 
 
329 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.69072  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.59 
 
 
346 aa  287  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>