More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1844 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
341 aa  674    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.496619  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2554  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  82.65 
 
 
341 aa  538  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.339877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2184  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.83 
 
 
341 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4855  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.76 
 
 
342 aa  358  6e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0075  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.21 
 
 
335 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.496128  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2786  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.21 
 
 
335 aa  332  6e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1616  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.2 
 
 
355 aa  304  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18154  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.96 
 
 
350 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.88 
 
 
354 aa  295  7e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1197  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45 
 
 
354 aa  295  9e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3011  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.27 
 
 
350 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000165502 
 
 
-
 
NC_002936  DET1416  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.45 
 
 
340 aa  292  5e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.578384  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1266  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.11 
 
 
366 aa  292  5e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.26065  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0677  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.53 
 
 
348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.54 
 
 
353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1268  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.38 
 
 
333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.642063  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0725  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.39 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0588894  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.94 
 
 
348 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.94 
 
 
349 aa  282  7.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.71 
 
 
349 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.11 
 
 
347 aa  281  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.23 
 
 
336 aa  279  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.31 
 
 
348 aa  278  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.01 
 
 
350 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.36 
 
 
348 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.29 
 
 
346 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.97 
 
 
348 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3066  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.94 
 
 
348 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04210  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.8 
 
 
411 aa  275  7e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.974384  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.2 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000154728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.1 
 
 
346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.12 
 
 
348 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01760  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.32 
 
 
351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1642  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.44 
 
 
347 aa  272  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.25 
 
 
346 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1649  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.44 
 
 
347 aa  272  7e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.43 
 
 
353 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.62 
 
 
350 aa  269  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.76 
 
 
357 aa  268  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1447  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.3 
 
 
341 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.95 
 
 
346 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0293  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.51 
 
 
346 aa  266  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.6 
 
 
348 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.32 
 
 
347 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.83 
 
 
355 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.32 
 
 
347 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.26 
 
 
350 aa  263  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.09 
 
 
357 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.45 
 
 
344 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477896 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3278  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  41.4 
 
 
348 aa  261  8.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.01 
 
 
347 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.91 
 
 
346 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.51 
 
 
357 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.87 
 
 
355 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.67 
 
 
346 aa  260  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.08 
 
 
363 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2176  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.88 
 
 
329 aa  260  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0142  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.81 
 
 
345 aa  259  4e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.45 
 
 
340 aa  259  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.76 
 
 
346 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.31 
 
 
346 aa  259  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.9 
 
 
348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.28 
 
 
354 aa  259  6e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000206442  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.14 
 
 
345 aa  259  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.76 
 
 
327 aa  259  6e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.84 
 
 
330 aa  258  7e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.54 
 
 
355 aa  258  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2063  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.21 
 
 
355 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  41.51 
 
 
359 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.07 
 
 
349 aa  258  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.61 
 
 
356 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.9 
 
 
379 aa  257  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.5 
 
 
355 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.82 
 
 
340 aa  256  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.32 
 
 
345 aa  257  3e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.77 
 
 
345 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.86 
 
 
363 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.99 
 
 
345 aa  256  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2059  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.08 
 
 
329 aa  256  5e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.894151  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3150  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.01 
 
 
342 aa  256  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.45 
 
 
345 aa  256  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.45 
 
 
345 aa  255  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.45 
 
 
345 aa  255  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.45 
 
 
345 aa  255  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.94 
 
 
349 aa  256  6e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  42.45 
 
 
345 aa  255  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.45 
 
 
345 aa  255  6e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.18 
 
 
369 aa  256  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.83 
 
 
346 aa  255  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.45 
 
 
345 aa  255  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.45 
 
 
345 aa  255  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3475  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.29 
 
 
385 aa  255  7e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.59 
 
 
345 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.03 
 
 
359 aa  255  9e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.03 
 
 
359 aa  255  9e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.72 
 
 
350 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.72 
 
 
350 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.51 
 
 
345 aa  255  9e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1966  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.75 
 
 
368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.72 
 
 
345 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>