More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0293 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0293  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  100 
 
 
346 aa  699    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.68 
 
 
349 aa  434  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.45 
 
 
348 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.87 
 
 
348 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.58 
 
 
348 aa  428  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3278  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.8 
 
 
348 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.47 
 
 
350 aa  418  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.35 
 
 
348 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.11 
 
 
350 aa  418  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.81 
 
 
348 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.94 
 
 
347 aa  395  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.79 
 
 
336 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.81 
 
 
354 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000206442  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.94 
 
 
345 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.038607  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2760  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.94 
 
 
352 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.42 
 
 
346 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.36 
 
 
345 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2380  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.65 
 
 
345 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0437006  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.14 
 
 
353 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.65 
 
 
345 aa  378  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000355661  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.79 
 
 
345 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.36 
 
 
345 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.23 
 
 
350 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1596  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.94 
 
 
345 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000121366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.79 
 
 
345 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.08 
 
 
345 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.49 
 
 
379 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.75 
 
 
356 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.34 
 
 
346 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.46 
 
 
345 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.49 
 
 
345 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55 
 
 
353 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1735  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.65 
 
 
345 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000490358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.62 
 
 
346 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.65 
 
 
345 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00650722  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.52 
 
 
359 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.62 
 
 
345 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.49 
 
 
346 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.1 
 
 
346 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2549  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.65 
 
 
345 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000317859  hitchhiker  0.000000000231938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.45 
 
 
346 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.14 
 
 
347 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.62 
 
 
346 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.14 
 
 
347 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.23 
 
 
350 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.26 
 
 
363 aa  371  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.14 
 
 
347 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.91 
 
 
345 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.26 
 
 
352 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.49 
 
 
346 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.33 
 
 
350 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2744  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.33 
 
 
345 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181532  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.19 
 
 
352 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.2 
 
 
347 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.43 
 
 
345 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.36 
 
 
358 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.65 
 
 
363 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.33 
 
 
345 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.49 
 
 
348 aa  363  3e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.71 
 
 
354 aa  362  4e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1672  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.27 
 
 
351 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0202  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.49 
 
 
350 aa  360  3e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0422268 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.5 
 
 
350 aa  359  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.35 
 
 
340 aa  359  4e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.25 
 
 
345 aa  358  5e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.25 
 
 
345 aa  358  6e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.25 
 
 
345 aa  358  6e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.55 
 
 
352 aa  358  6e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.25 
 
 
345 aa  358  6e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  54.25 
 
 
345 aa  358  6e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.25 
 
 
345 aa  358  6e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.25 
 
 
345 aa  358  6e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.16 
 
 
345 aa  358  9e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.96 
 
 
345 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.33 
 
 
345 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000154728  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.13 
 
 
351 aa  357  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.63 
 
 
346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.91 
 
 
346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.2 
 
 
349 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.96 
 
 
345 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.98 
 
 
350 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.98 
 
 
345 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.98 
 
 
345 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.98 
 
 
350 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.98 
 
 
345 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.75 
 
 
346 aa  355  5.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.46 
 
 
358 aa  355  6.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.49 
 
 
349 aa  355  8.999999999999999e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.2 
 
 
369 aa  354  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.33 
 
 
345 aa  353  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.06 
 
 
345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1839  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.87 
 
 
355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.71 
 
 
359 aa  352  4e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.14 
 
 
352 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.42 
 
 
352 aa  352  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.17 
 
 
350 aa  352  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.71 
 
 
359 aa  352  4e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.85 
 
 
352 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.12 
 
 
363 aa  349  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.12 
 
 
340 aa  348  6e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>