More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1631 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
347 aa  693    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.8 
 
 
346 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.28 
 
 
350 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.55 
 
 
348 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.55 
 
 
348 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.22 
 
 
349 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.87 
 
 
348 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.98 
 
 
348 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.38 
 
 
348 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.12 
 
 
350 aa  431  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.09 
 
 
350 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.69 
 
 
350 aa  424  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.06 
 
 
346 aa  421  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.46 
 
 
340 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.59 
 
 
340 aa  411  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0293  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.94 
 
 
346 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.02 
 
 
345 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000154728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.96 
 
 
346 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.39 
 
 
336 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3278  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.14 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.91 
 
 
339 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1137  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.34 
 
 
346 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.35 
 
 
344 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477896 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1447  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.34 
 
 
341 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.26 
 
 
353 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0725  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.01 
 
 
362 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0588894  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0277  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.7 
 
 
346 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.23 
 
 
345 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0325  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.1 
 
 
346 aa  368  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0283  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.1 
 
 
346 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0268  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.1 
 
 
346 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.16 
 
 
346 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0275  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.33 
 
 
347 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0369  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.1 
 
 
346 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0328  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.1 
 
 
346 aa  368  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0296  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.1 
 
 
346 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0271  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.1 
 
 
346 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.45 
 
 
346 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.76 
 
 
356 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3469  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.05 
 
 
341 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0342  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.8 
 
 
346 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4978  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.8 
 
 
346 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.25 
 
 
358 aa  363  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.45 
 
 
346 aa  363  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3011  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.58 
 
 
350 aa  362  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000165502 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.17 
 
 
379 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.52 
 
 
350 aa  359  4e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.3 
 
 
346 aa  358  6e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.3 
 
 
345 aa  358  9e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.15 
 
 
331 aa  358  9.999999999999999e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.866173  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.65 
 
 
347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.87 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.87 
 
 
346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.15 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.65 
 
 
347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.65 
 
 
347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.28 
 
 
359 aa  356  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1033  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.55 
 
 
337 aa  356  3.9999999999999996e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.14 
 
 
346 aa  355  5e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.71 
 
 
345 aa  355  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1761  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.4 
 
 
350 aa  355  6.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.93 
 
 
346 aa  355  7.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.3 
 
 
363 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.94 
 
 
359 aa  354  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.01 
 
 
353 aa  354  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.94 
 
 
359 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.17 
 
 
350 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1668  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.92 
 
 
350 aa  353  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269909  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.05 
 
 
354 aa  353  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000206442  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0673  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.4 
 
 
333 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1672  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.05 
 
 
351 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103618  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.47 
 
 
350 aa  353  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.49 
 
 
345 aa  352  4e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3150  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.71 
 
 
342 aa  352  5.9999999999999994e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1255  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.61 
 
 
345 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6858  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.21 
 
 
357 aa  351  8e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0051  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.89 
 
 
333 aa  351  8.999999999999999e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2702  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.29 
 
 
345 aa  350  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00227816  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2608  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.61 
 
 
345 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.38 
 
 
363 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0202  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.16 
 
 
350 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0422268 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1839  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.34 
 
 
355 aa  349  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.89 
 
 
352 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.41 
 
 
345 aa  349  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.92 
 
 
357 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.6 
 
 
345 aa  348  5e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.59 
 
 
345 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.59 
 
 
345 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.59 
 
 
345 aa  347  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.59 
 
 
345 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.59 
 
 
345 aa  347  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0738  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.01 
 
 
354 aa  347  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.59 
 
 
345 aa  347  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  50.59 
 
 
345 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50 
 
 
345 aa  347  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.7 
 
 
345 aa  348  1e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.59 
 
 
345 aa  347  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.59 
 
 
345 aa  347  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0879  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.37 
 
 
345 aa  348  1e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.94 
 
 
346 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>