30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01415 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01415  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  625  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.134141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0082  hypothetical protein  58.3 
 
 
281 aa  314  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4573  hypothetical protein  54.18 
 
 
293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0767452  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2054  hypothetical protein  50.33 
 
 
310 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627069  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0911  hypothetical protein  51.19 
 
 
300 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5454  hypothetical protein  50.36 
 
 
289 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.501577 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5649  hypothetical protein  58.77 
 
 
230 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00621516  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6339  hypothetical protein  48.77 
 
 
289 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6554  hypothetical protein  52.92 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145506  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0787  hypothetical protein  42.05 
 
 
312 aa  229  6e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0654  hypothetical protein  42.3 
 
 
312 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0508  hypothetical protein  42.81 
 
 
312 aa  225  6e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.647298  normal  0.0833781 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1931  hypothetical protein  40.26 
 
 
306 aa  219  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1303  hypothetical protein  41.2 
 
 
300 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.138879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3139  hypothetical protein  38.28 
 
 
305 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3270  hypothetical protein  37.29 
 
 
303 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2876  hypothetical protein  34.48 
 
 
287 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1285  abortive infection protein AbiGII  30.96 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4516  hypothetical protein  33.72 
 
 
283 aa  112  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0680  hypothetical protein  29.78 
 
 
278 aa  104  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0557  hypothetical protein  30.62 
 
 
285 aa  103  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000428757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5578  hypothetical protein  30.32 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  33.11 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3086  hypothetical protein  28.34 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25040  protein of unknown function (DUF1814)  26.16 
 
 
302 aa  60.1  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3282  hypothetical protein  28.74 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1070  hypothetical protein  27.69 
 
 
299 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3734  hypothetical protein  43.1 
 
 
62 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2937  hypothetical protein  24.45 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283866  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4918  Domain of unknown function DUF1814  24.14 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>