28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2054 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2054  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627069  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01415  hypothetical protein  50.33 
 
 
307 aa  293  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.134141  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5454  hypothetical protein  50.88 
 
 
289 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.501577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0911  hypothetical protein  48.97 
 
 
300 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6339  hypothetical protein  50 
 
 
289 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0082  hypothetical protein  47.29 
 
 
281 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4573  hypothetical protein  43.82 
 
 
293 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0767452  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6554  hypothetical protein  48.78 
 
 
281 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145506  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3139  hypothetical protein  40.52 
 
 
305 aa  242  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1303  hypothetical protein  44.04 
 
 
300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.138879  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5649  hypothetical protein  48.68 
 
 
230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00621516  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0508  hypothetical protein  37.58 
 
 
312 aa  209  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.647298  normal  0.0833781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0787  hypothetical protein  37.17 
 
 
312 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0654  hypothetical protein  36.93 
 
 
312 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3270  hypothetical protein  35.69 
 
 
303 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1931  hypothetical protein  36.16 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2876  hypothetical protein  35.32 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4516  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1285  abortive infection protein AbiGII  29.8 
 
 
281 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0680  hypothetical protein  26.95 
 
 
278 aa  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0557  hypothetical protein  26.27 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000428757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5578  hypothetical protein  29 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1070  hypothetical protein  28.06 
 
 
299 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  31.61 
 
 
251 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3282  hypothetical protein  28.57 
 
 
299 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25040  protein of unknown function (DUF1814)  26.18 
 
 
302 aa  49.3  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3086  hypothetical protein  30.48 
 
 
319 aa  46.2  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  26.19 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>