26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0787 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0787  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  641    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251982  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0508  hypothetical protein  96.47 
 
 
312 aa  620  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.647298  normal  0.0833781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0654  hypothetical protein  94.55 
 
 
312 aa  609  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1931  hypothetical protein  80.66 
 
 
306 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1303  hypothetical protein  56.27 
 
 
300 aa  348  8e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.138879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3139  hypothetical protein  53.8 
 
 
305 aa  333  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01415  hypothetical protein  42.05 
 
 
307 aa  229  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.134141  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6554  hypothetical protein  46.98 
 
 
281 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145506  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6339  hypothetical protein  42.01 
 
 
289 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5454  hypothetical protein  41.64 
 
 
289 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.501577 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3270  hypothetical protein  41.64 
 
 
303 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2054  hypothetical protein  37.17 
 
 
310 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627069  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4573  hypothetical protein  40.71 
 
 
293 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0767452  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0911  hypothetical protein  39.04 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0082  hypothetical protein  37.93 
 
 
281 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5649  hypothetical protein  39.74 
 
 
230 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00621516  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2876  hypothetical protein  32.35 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4516  hypothetical protein  33.71 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0680  hypothetical protein  30.18 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1285  abortive infection protein AbiGII  33.03 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5578  hypothetical protein  29.3 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0557  hypothetical protein  27.56 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000428757 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  26.59 
 
 
251 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1070  hypothetical protein  26.16 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3282  hypothetical protein  25 
 
 
299 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2895  ankyrin  22.37 
 
 
523 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115564  normal  0.481836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>