27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5649 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5649  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00621516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0082  hypothetical protein  82.03 
 
 		 281 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01415  hypothetical protein  58.77 
 
 		 307 aa  264  8.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.134141  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4573  hypothetical protein  58.26 
 
 		 293 aa  257  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0767452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0911  hypothetical protein  59.71 
 
 		 300 aa  255  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5454  hypothetical protein  53.24 
 
 		 289 aa  231  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.501577 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6554  hypothetical protein  51.08 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6339  hypothetical protein  50 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2054  hypothetical protein  48.68 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1303  hypothetical protein  40.79 
 
 		 300 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.138879  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0787  hypothetical protein  39.74 
 
 		 312 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0654  hypothetical protein  40.52 
 
 		 312 aa  161  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0508  hypothetical protein  39.74 
 
 		 312 aa  160  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.647298  normal  0.0833781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3139  hypothetical protein  41.29 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3270  hypothetical protein  40.37 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1931  hypothetical protein  37.72 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2876  hypothetical protein  35.92 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0680  hypothetical protein  31.63 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4516  hypothetical protein  38.98 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0557  hypothetical protein  31.34 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000428757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5578  hypothetical protein  35.29 
 
 		 303 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1285  abortive infection protein AbiGII  29.59 
 
 		 281 aa  91.3  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3282  hypothetical protein  32.57 
 
 		 299 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  29.93 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1070  hypothetical protein  30.86 
 
 		 299 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3734  hypothetical protein  80.77 
 
 		 62 aa  48.9  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6000  hypothetical protein  24.1 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>