30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0911 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0911  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4573  hypothetical protein  54.87 
 
 
293 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0767452  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0082  hypothetical protein  56.46 
 
 
281 aa  302  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01415  hypothetical protein  51.38 
 
 
307 aa  293  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.134141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2054  hypothetical protein  49.32 
 
 
310 aa  279  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627069  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5454  hypothetical protein  50.73 
 
 
289 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.501577 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6339  hypothetical protein  48.59 
 
 
289 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5649  hypothetical protein  58.11 
 
 
230 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00621516  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6554  hypothetical protein  50.62 
 
 
281 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145506  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1303  hypothetical protein  42.12 
 
 
300 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.138879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3270  hypothetical protein  38.13 
 
 
303 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0787  hypothetical protein  39.04 
 
 
312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251982  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0508  hypothetical protein  38.7 
 
 
312 aa  194  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.647298  normal  0.0833781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0654  hypothetical protein  38.7 
 
 
312 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3139  hypothetical protein  38.91 
 
 
305 aa  182  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1931  hypothetical protein  35.62 
 
 
306 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2876  hypothetical protein  37.12 
 
 
287 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1285  abortive infection protein AbiGII  28.06 
 
 
281 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5578  hypothetical protein  32.31 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0680  hypothetical protein  27.63 
 
 
278 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4516  hypothetical protein  34.15 
 
 
283 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0557  hypothetical protein  30.7 
 
 
285 aa  109  6e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000428757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3282  hypothetical protein  30.25 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1070  hypothetical protein  32.34 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  30.72 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3086  hypothetical protein  33.01 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25040  protein of unknown function (DUF1814)  28.23 
 
 
302 aa  56.2  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3734  hypothetical protein  43.1 
 
 
62 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4251  Domain of unknown function DUF1814  29.93 
 
 
537 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.176604  normal  0.224045 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22780  protein of unknown function (DUF1814)  25 
 
 
310 aa  42.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.329909  normal  0.787937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>