28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6339 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6339  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5454  hypothetical protein  87.54 
 
 		 289 aa  517  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.501577 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6554  hypothetical protein  54.88 
 
 		 281 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01415  hypothetical protein  48.77 
 
 		 307 aa  256  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.134141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2054  hypothetical protein  50 
 
 		 310 aa  255  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0911  hypothetical protein  48.59 
 
 		 300 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0082  hypothetical protein  44.98 
 
 		 281 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1303  hypothetical protein  44.91 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.138879  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4573  hypothetical protein  45.62 
 
 		 293 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0767452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0654  hypothetical protein  42.66 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0508  hypothetical protein  42.01 
 
 		 312 aa  223  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.647298  normal  0.0833781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0787  hypothetical protein  42.01 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251982  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1931  hypothetical protein  41.99 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5649  hypothetical protein  50 
 
 		 230 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00621516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3139  hypothetical protein  37.94 
 
 		 305 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3270  hypothetical protein  36.92 
 
 		 303 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1285  abortive infection protein AbiGII  30.26 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4516  hypothetical protein  32.67 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2876  hypothetical protein  32.08 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0680  hypothetical protein  30.46 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5578  hypothetical protein  29.96 
 
 		 303 aa  99  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0557  hypothetical protein  28.23 
 
 		 285 aa  92.4  9e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000428757 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  29.51 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1070  hypothetical protein  29.33 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3282  hypothetical protein  30.08 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3734  hypothetical protein  44.83 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25040  protein of unknown function (DUF1814)  26.29 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4251  Domain of unknown function DUF1814  28.57 
 
 		 537 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.176604  normal  0.224045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>