27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3282 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3282  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1070  hypothetical protein  91.3 
 
 
299 aa  537  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22780  protein of unknown function (DUF1814)  31.87 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.329909  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25040  protein of unknown function (DUF1814)  29.61 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4918  Domain of unknown function DUF1814  31.6 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4573  hypothetical protein  31.89 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0767452  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3086  hypothetical protein  28.85 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3270  hypothetical protein  26.05 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0911  hypothetical protein  30.25 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0082  hypothetical protein  32.46 
 
 
281 aa  63.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5578  hypothetical protein  28.12 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5454  hypothetical protein  30.94 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.501577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3139  hypothetical protein  24.65 
 
 
305 aa  59.7  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5649  hypothetical protein  32.57 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00621516  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6339  hypothetical protein  30.08 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01415  hypothetical protein  28.74 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.134141  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5472  hypothetical protein  26.37 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590997  normal  0.790383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2054  hypothetical protein  28.57 
 
 
310 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627069  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1931  hypothetical protein  24.91 
 
 
306 aa  52.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6554  hypothetical protein  30.95 
 
 
281 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145506  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02710  protein of unknown function (DUF1814)  27.87 
 
 
268 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0508  hypothetical protein  25.29 
 
 
312 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.647298  normal  0.0833781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0787  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0654  hypothetical protein  25.67 
 
 
312 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4516  hypothetical protein  29.85 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2876  hypothetical protein  29.44 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11063  hypothetical protein  26.69 
 
 
293 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>