18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25040 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_25040  protein of unknown function (DUF1814)  100 
 
 
302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3086  hypothetical protein  53.06 
 
 
319 aa  290  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5472  hypothetical protein  30.39 
 
 
339 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590997  normal  0.790383 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22780  protein of unknown function (DUF1814)  31.25 
 
 
310 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.329909  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3282  hypothetical protein  29.61 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4918  Domain of unknown function DUF1814  28.01 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1070  hypothetical protein  28.76 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01415  hypothetical protein  26.16 
 
 
307 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.134141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3270  hypothetical protein  25.62 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0680  hypothetical protein  23.89 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3139  hypothetical protein  23.57 
 
 
305 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2876  hypothetical protein  27.64 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0082  hypothetical protein  26.05 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2054  hypothetical protein  26.18 
 
 
310 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627069  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6339  hypothetical protein  26.29 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0911  hypothetical protein  28.23 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5454  hypothetical protein  30.14 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.501577 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4573  hypothetical protein  26.41 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0767452  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>