27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0680 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0680  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  548  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0557  hypothetical protein  39.18 
 
 
285 aa  206  3e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000428757 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1285  abortive infection protein AbiGII  39.55 
 
 
281 aa  184  9e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3270  hypothetical protein  30.86 
 
 
303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4573  hypothetical protein  29.02 
 
 
293 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0767452  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2876  hypothetical protein  32.99 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6554  hypothetical protein  32.2 
 
 
281 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145506  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0508  hypothetical protein  30.8 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.647298  normal  0.0833781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3139  hypothetical protein  33.17 
 
 
305 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0654  hypothetical protein  30.8 
 
 
312 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0787  hypothetical protein  30.18 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251982  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1931  hypothetical protein  29.61 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5454  hypothetical protein  28.74 
 
 
289 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.501577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0911  hypothetical protein  27.73 
 
 
300 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5649  hypothetical protein  31.63 
 
 
230 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00621516  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1303  hypothetical protein  29.46 
 
 
300 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.138879  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01415  hypothetical protein  29.78 
 
 
307 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.134141  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6339  hypothetical protein  30.46 
 
 
289 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2054  hypothetical protein  26.95 
 
 
310 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627069  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0082  hypothetical protein  26.77 
 
 
281 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4516  hypothetical protein  31.69 
 
 
283 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5578  hypothetical protein  32.02 
 
 
303 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  33.82 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  26.58 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1791  hypothetical protein  80 
 
 
43 aa  54.7  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.1575  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2937  hypothetical protein  25.11 
 
 
269 aa  53.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283866  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25040  protein of unknown function (DUF1814)  23.89 
 
 
302 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>