28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3139 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3139  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  634    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1303  hypothetical protein  57.38 
 
 		 300 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.138879  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0654  hypothetical protein  54.46 
 
 		 312 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0508  hypothetical protein  54.13 
 
 		 312 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.647298  normal  0.0833781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0787  hypothetical protein  53.8 
 
 		 312 aa  333  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251982  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1931  hypothetical protein  51.82 
 
 		 306 aa  321  9.000000000000001e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2054  hypothetical protein  40.52 
 
 		 310 aa  242  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5454  hypothetical protein  38.3 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.501577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01415  hypothetical protein  38.28 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.134141  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6339  hypothetical protein  37.94 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6554  hypothetical protein  40.77 
 
 		 281 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3270  hypothetical protein  33.56 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0911  hypothetical protein  38.91 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0082  hypothetical protein  36.5 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4573  hypothetical protein  34.64 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0767452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5649  hypothetical protein  41.29 
 
 		 230 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00621516  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2876  hypothetical protein  31.75 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4516  hypothetical protein  31.58 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0680  hypothetical protein  33.17 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0557  hypothetical protein  32.38 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000428757 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1285  abortive infection protein AbiGII  31.16 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5578  hypothetical protein  28.41 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1070  hypothetical protein  23.73 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  30.07 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3282  hypothetical protein  24.65 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25040  protein of unknown function (DUF1814)  23.57 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2895  ankyrin  22.08 
 
 		 523 aa  43.9  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115564  normal  0.481836 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3086  hypothetical protein  24.4 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>