70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_48819 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_48819  DNA-binding protein (Carbon catabolite repressor)  100 
 
 
250 aa  501  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06195  DNA-binding protein creA (Carbon catabolite repressor) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q01981]  39.33 
 
 
416 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000354127  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67859  transcription factor involved in glucose repression  80.82 
 
 
579 aa  136  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00550  DNA-binding protein cre-1, putative  37.69 
 
 
737 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141726  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00600  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  49.23 
 
 
716 aa  79  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04070  transcriptional regulator nrg2, putative  43.94 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05810  conserved hypothetical protein  54.55 
 
 
851 aa  66.2  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109949  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80808  putative zinc finger protein  50.91 
 
 
802 aa  65.9  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.10969 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68294  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  51.72 
 
 
1009 aa  63.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02290  Transcription factor steA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O74252]  54.55 
 
 
692 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243472  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64902  possible regulatory protein  50 
 
 
675 aa  63.5  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.459104  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01997  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10380)  41.27 
 
 
428 aa  62.8  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32504  transcriptional repressor  39.47 
 
 
258 aa  62  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0168465 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80960  Zinc Finger Protein C2H2-like protein  44.58 
 
 
1195 aa  61.6  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758804  normal  0.0450473 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05583  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11480)  54.24 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018234  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51364  protein similar to protein that controls the expression of ADH2, peroxisomal protein genes, and genes required for ethanol, glycerol, and fatty acid utilization  50 
 
 
1211 aa  60.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352495  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_09492  DNA binding regulatory protein AmdX [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79045]  48.44 
 
 
1150 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100907  normal  0.703915 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00973  Regulatory protein brlA (Bristle A protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10069]  46.03 
 
 
432 aa  60.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33273  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  43.08 
 
 
857 aa  60.1  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0974911  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04263  NSDC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q56UE1]  41.94 
 
 
667 aa  60.1  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00306213  normal  0.1267 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02270  Putative uncharacterized proteinRegulatory protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00170]  54 
 
 
880 aa  60.1  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.132448  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04013  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04110)  51.92 
 
 
864 aa  59.7  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67626  zinc finger protein  35.8 
 
 
543 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.482303  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01980  zinc-finger protein, putative  39.08 
 
 
462 aa  58.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.925547  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01652  C2H2 transcription factor (Seb1), putative, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09080)  38.04 
 
 
580 aa  57.4  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.301419 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02160  conserved hypothetical protein  38.03 
 
 
746 aa  56.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67778  ADR1-like Zn finger domain protein  45.45 
 
 
1049 aa  56.2  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.119069 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05726  Putative transcription factor CrzAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B154]  41.67 
 
 
730 aa  55.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242002  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00096  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  52.08 
 
 
993 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04720  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  50 
 
 
313 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000217487  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88332  DNA-binding transcription factor  35.37 
 
 
421 aa  54.3  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67047  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  40 
 
 
781 aa  53.9  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.928485  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02421  Putative uncharacterized proteinPutative zinc finger protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74256]  43.4 
 
 
354 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0534008 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01265  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10080)  41.79 
 
 
627 aa  53.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.180578 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07118  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  48.08 
 
 
991 aa  53.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00290  conserved hypothetical protein  41.51 
 
 
815 aa  52.8  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06503  C2H2 transcription factor (Azf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05160)  44.07 
 
 
457 aa  52.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61434  calcineurin responsive zinc-finger  35.92 
 
 
225 aa  52  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.383997 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05003  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09820)  49.06 
 
 
596 aa  52  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04873  C2H2 transcription factor (Swi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11250)  47.06 
 
 
741 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.342827 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00870  RNA polymerase II transcription factor, putative  51.11 
 
 
650 aa  50.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68117  Up in starvation  37.5 
 
 
583 aa  50.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67866  asparagine-rich zinc finger protein  38.89 
 
 
465 aa  49.7  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.12306 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05966  RfeC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J177]  41.18 
 
 
519 aa  49.7  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.247112  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67179  C2H2 zinc finger protein Ribonuc_L-PSP Endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 
724 aa  49.3  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10910  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  40.32 
 
 
913 aa  48.9  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401356  normal  0.142996 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05659  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13600)  48 
 
 
314 aa  48.9  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504143  normal  0.402807 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30617  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  49.02 
 
 
416 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.995284 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08741  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02690)  46.43 
 
 
311 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000382174  normal  0.0385189 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11112  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  40.82 
 
 
446 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06733  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05960)  33.33 
 
 
1003 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.425426  normal  0.941684 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31236  Strongly-conserved Zn-finger binding protein (TFIIIA)  34.88 
 
 
449 aa  47  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.269579  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02748  C2H2 transcription factor (TFIIIA), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05150)  30.21 
 
 
585 aa  46.2  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121213  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08663  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G01910)  42.59 
 
 
730 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.872321 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09025  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  41.07 
 
 
891 aa  45.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01254  C2H2 finger domain protein (Gli3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10280)  51.52 
 
 
377 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.33756  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03070  hypothetical protein  39.62 
 
 
1161 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03060  C2H2 zinc finger protein Zas1A, putative  40.68 
 
 
1078 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00590  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  42.59 
 
 
333 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01705  conserved hypothetical protein  42.5 
 
 
521 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.25113 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85279  Metallothionein expression activator  40 
 
 
626 aa  43.9  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.608968  normal  0.706562 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50873  ADR1-like protein  45.9 
 
 
146 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02855  pH-response transcription factor pacC/RIM101 Precursor [Contains pH-response transcription factor pacC/RIM101 closed form;pH-response transcription factor pacC/RIM101 open form 1;pH-response transcription factor pacC/RIM101 open form 2] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00202]  38 
 
 
678 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129543  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01251  C2H2 transcription factor (Egr2), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10230)  39.66 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.200479  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00970  transcription factor PacC, putative  42.86 
 
 
917 aa  43.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.40767  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04340  transcription factor iiia, putative  32.05 
 
 
544 aa  43.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0235343  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67657  protein involved in methionine metabolism  36.25 
 
 
513 aa  42.7  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.316751  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00890  early growth response protein 1 (egr-1), putative  42.86 
 
 
662 aa  42.4  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04900  conserved hypothetical protein  46.34 
 
 
845 aa  42.4  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.266265  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01450  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
1089 aa  42.4  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>