68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68117 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_68117  Up in starvation  100 
 
 
583 aa  1185    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05003  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09820)  70.77 
 
 
596 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00870  RNA polymerase II transcription factor, putative  66.67 
 
 
650 aa  99  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03070  hypothetical protein  39.24 
 
 
1161 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51364  protein similar to protein that controls the expression of ADH2, peroxisomal protein genes, and genes required for ethanol, glycerol, and fatty acid utilization  48.39 
 
 
1211 aa  69.3  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352495  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02290  Transcription factor steA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O74252]  59.57 
 
 
692 aa  68.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243472  normal  0.712595 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02270  Putative uncharacterized proteinRegulatory protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00170]  41.18 
 
 
880 aa  67.8  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.132448  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33273  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  41.07 
 
 
857 aa  67.8  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0974911  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_09492  DNA binding regulatory protein AmdX [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79045]  41.57 
 
 
1150 aa  67.8  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100907  normal  0.703915 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80960  Zinc Finger Protein C2H2-like protein  36.59 
 
 
1195 aa  65.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758804  normal  0.0450473 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07118  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  54 
 
 
991 aa  62.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67778  ADR1-like Zn finger domain protein  47.27 
 
 
1049 aa  62  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.119069 
 
 
-
 
NC_006686  CND05810  conserved hypothetical protein  57.78 
 
 
851 aa  60.8  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109949  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11112  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  50 
 
 
446 aa  60.8  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64902  possible regulatory protein  42.59 
 
 
675 aa  60.1  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.459104  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00600  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  44.26 
 
 
716 aa  59.7  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01251  C2H2 transcription factor (Egr2), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10230)  52.17 
 
 
242 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.200479  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08735  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  49.02 
 
 
443 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68294  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  49.06 
 
 
1009 aa  59.3  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06503  C2H2 transcription factor (Azf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05160)  45.9 
 
 
457 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67859  transcription factor involved in glucose repression  38.82 
 
 
579 aa  57.8  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03060  C2H2 zinc finger protein Zas1A, putative  38.46 
 
 
1078 aa  58.2  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01652  C2H2 transcription factor (Seb1), putative, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09080)  48.21 
 
 
580 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.301419 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05966  RfeC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J177]  44.23 
 
 
519 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.247112  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04263  NSDC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q56UE1]  42.11 
 
 
667 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00306213  normal  0.1267 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32504  transcriptional repressor  55.32 
 
 
258 aa  55.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0168465 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00973  Regulatory protein brlA (Bristle A protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10069]  46.55 
 
 
432 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00096  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  35.96 
 
 
993 aa  55.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06195  DNA-binding protein creA (Carbon catabolite repressor) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q01981]  43.08 
 
 
416 aa  54.3  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000354127  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00550  DNA-binding protein cre-1, putative  46.43 
 
 
737 aa  53.9  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141726  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04720  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  45.76 
 
 
313 aa  53.9  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000217487  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04070  transcriptional regulator nrg2, putative  44.07 
 
 
359 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02160  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 
746 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04013  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04110)  45.45 
 
 
864 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00590  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  44.07 
 
 
333 aa  52.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67866  asparagine-rich zinc finger protein  42.11 
 
 
465 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.12306 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67657  protein involved in methionine metabolism  42.86 
 
 
513 aa  52.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.316751  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05726  Putative transcription factor CrzAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B154]  34.74 
 
 
730 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242002  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88332  DNA-binding transcription factor  44.64 
 
 
421 aa  52  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50873  ADR1-like protein  44.83 
 
 
146 aa  51.6  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01980  zinc-finger protein, putative  57.5 
 
 
462 aa  51.2  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.925547  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29464  C2H2 zinc finger protein  31.71 
 
 
712 aa  51.2  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48819  DNA-binding protein (Carbon catabolite repressor)  36.56 
 
 
250 aa  51.2  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11197  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  33.33 
 
 
865 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10910  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  44.44 
 
 
913 aa  50.4  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401356  normal  0.142996 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67047  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  40.35 
 
 
781 aa  50.4  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.928485  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06733  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05960)  30 
 
 
1003 aa  50.4  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.425426  normal  0.941684 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00390  expressed protein  40.38 
 
 
691 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85279  Metallothionein expression activator  37.04 
 
 
626 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.608968  normal  0.706562 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02421  Putative uncharacterized proteinPutative zinc finger protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74256]  44.68 
 
 
354 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0534008 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01450  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 
1089 aa  48.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05659  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13600)  37.7 
 
 
314 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504143  normal  0.402807 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30535  SWI5-like zinc finger protein  42.42 
 
 
520 aa  47.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.688222  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04873  C2H2 transcription factor (Swi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11250)  31.82 
 
 
741 aa  48.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.342827 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30617  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  31.11 
 
 
416 aa  47.8  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.995284 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04340  transcription factor iiia, putative  38 
 
 
544 aa  47.8  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0235343  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08663  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G01910)  41.51 
 
 
730 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.872321 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00970  transcription factor PacC, putative  30.77 
 
 
917 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.40767  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01997  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10380)  39.58 
 
 
428 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34444  pH-response transcription factor pacC/RIM101-like protein  30.16 
 
 
642 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.456628  normal  0.884424 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05583  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11480)  44.07 
 
 
306 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018234  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11195  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  45.83 
 
 
453 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.622615 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02855  pH-response transcription factor pacC/RIM101 Precursor [Contains pH-response transcription factor pacC/RIM101 closed form;pH-response transcription factor pacC/RIM101 open form 1;pH-response transcription factor pacC/RIM101 open form 2] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00202]  29.58 
 
 
678 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129543  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08741  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02690)  38.78 
 
 
311 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000382174  normal  0.0385189 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00890  early growth response protein 1 (egr-1), putative  45.28 
 
 
662 aa  43.9  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06060  expressed protein  41.51 
 
 
477 aa  43.5  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01265  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10080)  40 
 
 
627 aa  43.5  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.180578 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01254  C2H2 finger domain protein (Gli3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10280)  47.62 
 
 
377 aa  43.5  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.33756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>