60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN00550 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006683  CNN00550  DNA-binding protein cre-1, putative  100 
 
 		 737 aa  1492    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141726  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06195  DNA-binding protein creA (Carbon catabolite repressor) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q01981]  66.67 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000354127  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48819  DNA-binding protein (Carbon catabolite repressor)  38.19 
 
 		 250 aa  122  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67859  transcription factor involved in glucose repression  83.33 
 
 		 579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02290  Transcription factor steA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O74252]  48.78 
 
 		 692 aa  78.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243472  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00600  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  56.36 
 
 		 716 aa  78.2  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05810  conserved hypothetical protein  56.36 
 
 		 851 aa  69.7  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109949  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51364  protein similar to protein that controls the expression of ADH2, peroxisomal protein genes, and genes required for ethanol, glycerol, and fatty acid utilization  53.7 
 
 		 1211 aa  68.6  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80808  putative zinc finger protein  48.28 
 
 		 802 aa  66.6  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.10969 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04013  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04110)  54.1 
 
 		 864 aa  67  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68294  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  50.79 
 
 		 1009 aa  66.6  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80960  Zinc Finger Protein C2H2-like protein  40.91 
 
 		 1195 aa  65.9  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758804  normal  0.0450473 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_09492  DNA binding regulatory protein AmdX [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79045]  48.44 
 
 		 1150 aa  65.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100907  normal  0.703915 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64902  possible regulatory protein  50 
 
 		 675 aa  65.1  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.459104  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02270  Putative uncharacterized proteinRegulatory protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00170]  46.48 
 
 		 880 aa  65.1  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04070  transcriptional regulator nrg2, putative  45.31 
 
 		 359 aa  63.5  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00973  Regulatory protein brlA (Bristle A protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10069]  37 
 
 		 432 aa  63.9  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67778  ADR1-like Zn finger domain protein  50.94 
 
 		 1049 aa  63.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.119069 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05583  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11480)  54.39 
 
 		 306 aa  62  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018234  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04263  NSDC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q56UE1]  38.36 
 
 		 667 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00306213  normal  0.1267 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01652  C2H2 transcription factor (Seb1), putative, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09080)  49.15 
 
 		 580 aa  59.3  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.301419 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33273  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  41.67 
 
 		 857 aa  58.5  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0974911  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01980  zinc-finger protein, putative  54.35 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.925547  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01997  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10380)  42.86 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02421  Putative uncharacterized proteinPutative zinc finger protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74256]  36.62 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0534008 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07118  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  43.75 
 
 		 991 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00096  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  42.42 
 
 		 993 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32504  transcriptional repressor  43.64 
 
 		 258 aa  56.6  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0168465 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02160  conserved hypothetical protein  42.11 
 
 		 746 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00290  conserved hypothetical protein  41.51 
 
 		 815 aa  55.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67626  zinc finger protein  37.1 
 
 		 543 aa  55.5  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.482303  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05003  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09820)  44.62 
 
 		 596 aa  55.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04720  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  52 
 
 		 313 aa  54.7  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000217487  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00870  RNA polymerase II transcription factor, putative  48.21 
 
 		 650 aa  54.3  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01265  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10080)  35.37 
 
 		 627 aa  53.9  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.180578 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68117  Up in starvation  46.43 
 
 		 583 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05726  Putative transcription factor CrzAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B154]  40 
 
 		 730 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242002  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08663  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G01910)  44.44 
 
 		 730 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.872321 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04873  C2H2 transcription factor (Swi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11250)  47.06 
 
 		 741 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.342827 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06503  C2H2 transcription factor (Azf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05160)  40.32 
 
 		 457 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50873  ADR1-like protein  50.91 
 
 		 146 aa  52  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67047  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  38.33 
 
 		 781 aa  52.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.928485  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05659  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13600)  37.37 
 
 		 314 aa  52  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504143  normal  0.402807 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05966  RfeC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J177]  40.82 
 
 		 519 aa  51.2  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.247112  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08741  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02690)  47.06 
 
 		 311 aa  50.8  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000382174  normal  0.0385189 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88332  DNA-binding transcription factor  39.34 
 
 		 421 aa  50.8  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10910  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  42.42 
 
 		 913 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401356  normal  0.142996 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30617  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  57.58 
 
 		 416 aa  48.5  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.995284 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11112  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  35.94 
 
 		 446 aa  47.8  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67866  asparagine-rich zinc finger protein  30.77 
 
 		 465 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.12306 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61434  calcineurin responsive zinc-finger  37.74 
 
 		 225 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.383997 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04340  transcription factor iiia, putative  38.6 
 
 		 544 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0235343  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00590  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  42.59 
 
 		 333 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03070  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1161 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03060  C2H2 zinc finger protein Zas1A, putative  39.62 
 
 		 1078 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01254  C2H2 finger domain protein (Gli3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10280)  54.55 
 
 		 377 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.33756  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09025  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  41.67 
 
 		 891 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42941  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  39.29 
 
 		 794 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.48255  normal  0.719128 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85279  Metallothionein expression activator  39.06 
 
 		 626 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.608968  normal  0.706562 
 
 
-
 
NC_006686  CND01440  conserved hypothetical protein  39.62 
 
 		 453 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>