67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_64902 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_64902  possible regulatory protein  100 
 
 
675 aa  1370    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.459104  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02421  Putative uncharacterized proteinPutative zinc finger protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74256]  52.63 
 
 
354 aa  73.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0534008 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67859  transcription factor involved in glucose repression  44 
 
 
579 aa  73.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00973  Regulatory protein brlA (Bristle A protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10069]  50.79 
 
 
432 aa  73.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00550  DNA-binding protein cre-1, putative  46.03 
 
 
737 aa  72.4  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141726  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00096  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  48.39 
 
 
993 aa  70.1  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48819  DNA-binding protein (Carbon catabolite repressor)  45.16 
 
 
250 aa  68.6  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_09492  DNA binding regulatory protein AmdX [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79045]  45.9 
 
 
1150 aa  67.4  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100907  normal  0.703915 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06195  DNA-binding protein creA (Carbon catabolite repressor) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q01981]  42.62 
 
 
416 aa  67  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000354127  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_006686  CND05810  conserved hypothetical protein  41.46 
 
 
851 aa  66.6  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109949  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01652  C2H2 transcription factor (Seb1), putative, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09080)  51.85 
 
 
580 aa  65.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.301419 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04013  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04110)  54 
 
 
864 aa  65.1  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02290  Transcription factor steA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O74252]  45.16 
 
 
692 aa  64.7  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243472  normal  0.712595 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05003  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09820)  39.06 
 
 
596 aa  63.9  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80960  Zinc Finger Protein C2H2-like protein  44.64 
 
 
1195 aa  63.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758804  normal  0.0450473 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67778  ADR1-like Zn finger domain protein  40.32 
 
 
1049 aa  63.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.119069 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06503  C2H2 transcription factor (Azf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05160)  34.78 
 
 
457 aa  63.9  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.843085 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10910  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  43.75 
 
 
913 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401356  normal  0.142996 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68294  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  50.88 
 
 
1009 aa  62.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33273  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  52 
 
 
857 aa  62.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0974911  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00290  conserved hypothetical protein  39.71 
 
 
815 aa  61.2  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00870  RNA polymerase II transcription factor, putative  46.15 
 
 
650 aa  60.5  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51364  protein similar to protein that controls the expression of ADH2, peroxisomal protein genes, and genes required for ethanol, glycerol, and fatty acid utilization  43.4 
 
 
1211 aa  59.7  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352495  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67626  zinc finger protein  36.21 
 
 
543 aa  59.3  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.482303  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68117  Up in starvation  42.59 
 
 
583 aa  59.3  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67047  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  38.24 
 
 
781 aa  58.9  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.928485  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02270  Putative uncharacterized proteinRegulatory protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00170]  40.3 
 
 
880 aa  58.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.132448  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07118  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  47.92 
 
 
991 aa  57.8  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04263  NSDC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q56UE1]  40.3 
 
 
667 aa  58.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00306213  normal  0.1267 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04720  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  37.31 
 
 
313 aa  57.4  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000217487  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00600  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  38.33 
 
 
716 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04070  transcriptional regulator nrg2, putative  38.6 
 
 
359 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03060  C2H2 zinc finger protein Zas1A, putative  34.85 
 
 
1078 aa  55.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88332  DNA-binding transcription factor  38.46 
 
 
421 aa  53.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08741  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02690)  38.33 
 
 
311 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000382174  normal  0.0385189 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01254  C2H2 finger domain protein (Gli3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10280)  37.1 
 
 
377 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.33756  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01440  conserved hypothetical protein  37.29 
 
 
453 aa  52  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66620  zinc finger protein involved in pre-tRNA splicing  39.39 
 
 
644 aa  52.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.859513  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04873  C2H2 transcription factor (Swi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11250)  37.7 
 
 
741 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.342827 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01251  C2H2 transcription factor (Egr2), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10230)  37.5 
 
 
242 aa  50.8  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.200479  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03070  hypothetical protein  35.59 
 
 
1161 aa  50.8  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05726  Putative transcription factor CrzAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B154]  33.33 
 
 
730 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242002  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02160  conserved hypothetical protein  28.21 
 
 
746 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31236  Strongly-conserved Zn-finger binding protein (TFIIIA)  38.89 
 
 
449 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.269579  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00590  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  46.94 
 
 
333 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32504  transcriptional repressor  37.04 
 
 
258 aa  49.3  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0168465 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05659  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13600)  36.67 
 
 
314 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504143  normal  0.402807 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67866  asparagine-rich zinc finger protein  43.1 
 
 
465 aa  48.9  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.12306 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02748  C2H2 transcription factor (TFIIIA), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05150)  37.93 
 
 
585 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121213  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66679  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  34.52 
 
 
664 aa  48.1  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.124089  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61434  calcineurin responsive zinc-finger  46.81 
 
 
225 aa  48.1  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.383997 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67179  C2H2 zinc finger protein Ribonuc_L-PSP Endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 
724 aa  47.8  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05966  RfeC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J177]  32.26 
 
 
519 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.247112  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00890  early growth response protein 1 (egr-1), putative  42.37 
 
 
662 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06733  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05960)  30.56 
 
 
1003 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.425426  normal  0.941684 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67657  protein involved in methionine metabolism  38.71 
 
 
513 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.316751  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00578  C2H2 finger domain protein (Ezf), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11170)  37.29 
 
 
311 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.435513  normal  0.342241 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04340  transcription factor iiia, putative  29.2 
 
 
544 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0235343  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85279  Metallothionein expression activator  34.62 
 
 
626 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.608968  normal  0.706562 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01705  conserved hypothetical protein  40.74 
 
 
521 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.25113 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01450  conserved hypothetical protein  39.29 
 
 
1089 aa  45.8  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08663  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G01910)  41.18 
 
 
730 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.872321 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30617  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  47.22 
 
 
416 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.995284 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04900  conserved hypothetical protein  44.74 
 
 
845 aa  45.4  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.266265  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54178  C2H2 zinc finger protein  31.88 
 
 
1158 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80808  putative zinc finger protein  41.51 
 
 
802 aa  45.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.10969 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01997  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10380)  29.7 
 
 
428 aa  44.3  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>