42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31236 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_31236  Strongly-conserved Zn-finger binding protein (TFIIIA)  100 
 
 		 449 aa  928    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.269579  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02748  C2H2 transcription factor (TFIIIA), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05150)  30.4 
 
 		 585 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121213  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04340  transcription factor iiia, putative  34.08 
 
 		 544 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0235343  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06503  C2H2 transcription factor (Azf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05160)  36.03 
 
 		 457 aa  88.2  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01265  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10080)  38.51 
 
 		 627 aa  84.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.180578 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00600  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  36.67 
 
 		 716 aa  84  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02160  conserved hypothetical protein  34.65 
 
 		 746 aa  81.3  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80808  putative zinc finger protein  32.65 
 
 		 802 aa  75.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.10969 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67866  asparagine-rich zinc finger protein  44.74 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.12306 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05583  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11480)  30.56 
 
 		 306 aa  67  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88332  DNA-binding transcription factor  33.33 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01997  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10380)  35.64 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01980  zinc-finger protein, putative  43.75 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.925547  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16521  predicted protein  24.63 
 
 		 246 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.487842 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00290  conserved hypothetical protein  44.64 
 
 		 815 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01450  conserved hypothetical protein  30.83 
 
 		 1089 aa  50.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01254  C2H2 finger domain protein (Gli3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10280)  40.35 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.33756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67047  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  33.66 
 
 		 781 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.928485  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05726  Putative transcription factor CrzAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B154]  34.02 
 
 		 730 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67778  ADR1-like Zn finger domain protein  36.62 
 
 		 1049 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.119069 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64902  possible regulatory protein  40 
 
 		 675 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.459104  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06733  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05960)  33.33 
 
 		 1003 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.425426  normal  0.941684 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80960  Zinc Finger Protein C2H2-like protein  41.67 
 
 		 1195 aa  48.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758804  normal  0.0450473 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08741  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02690)  40.38 
 
 		 311 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000382174  normal  0.0385189 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48819  DNA-binding protein (Carbon catabolite repressor)  34.88 
 
 		 250 aa  47.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03070  hypothetical protein  35.85 
 
 		 1161 aa  47  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85279  Metallothionein expression activator  32.14 
 
 		 626 aa  47.4  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.608968  normal  0.706562 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30617  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  39.66 
 
 		 416 aa  47  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.995284 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00970  transcription factor PacC, putative  33.33 
 
 		 917 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.40767  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07118  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  47.92 
 
 		 991 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29464  C2H2 zinc finger protein  37.5 
 
 		 712 aa  44.3  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68294  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  40.98 
 
 		 1009 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05810  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 		 851 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109949  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00096  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  41.07 
 
 		 993 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51364  protein similar to protein that controls the expression of ADH2, peroxisomal protein genes, and genes required for ethanol, glycerol, and fatty acid utilization  36.67 
 
 		 1211 aa  43.9  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352495  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04873  C2H2 transcription factor (Swi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11250)  32.93 
 
 		 741 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.342827 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02855  pH-response transcription factor pacC/RIM101 Precursor [Contains pH-response transcription factor pacC/RIM101 closed form;pH-response transcription factor pacC/RIM101 open form 1;pH-response transcription factor pacC/RIM101 open form 2] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00202]  28.07 
 
 		 678 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68117  Up in starvation  38.89 
 
 		 583 aa  43.5  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00550  DNA-binding protein cre-1, putative  33.78 
 
 		 737 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141726  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61434  calcineurin responsive zinc-finger  32.41 
 
 		 225 aa  43.5  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.383997 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42941  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  35.09 
 
 		 794 aa  43.5  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.48255  normal  0.719128 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67859  transcription factor involved in glucose repression  38.24 
 
 		 579 aa  43.1  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>