46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32504 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_32504  transcriptional repressor  100 
 
 		 258 aa  527  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0168465 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04070  transcriptional regulator nrg2, putative  58.49 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48819  DNA-binding protein (Carbon catabolite repressor)  39.47 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06195  DNA-binding protein creA (Carbon catabolite repressor) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q01981]  38.81 
 
 		 416 aa  62.4  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000354127  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67626  zinc finger protein  31.33 
 
 		 543 aa  61.6  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.482303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80808  putative zinc finger protein  45.1 
 
 		 802 aa  60.5  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.10969 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67859  transcription factor involved in glucose repression  37.5 
 
 		 579 aa  58.9  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01997  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10380)  38.46 
 
 		 428 aa  58.9  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00550  DNA-binding protein cre-1, putative  43.64 
 
 		 737 aa  58.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141726  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67179  C2H2 zinc finger protein Ribonuc_L-PSP Endoribonuclease L-PSP  39.71 
 
 		 724 aa  57  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01251  C2H2 transcription factor (Egr2), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10230)  29.57 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.200479  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02160  conserved hypothetical protein  42.59 
 
 		 746 aa  56.2  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02290  Transcription factor steA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O74252]  33.9 
 
 		 692 aa  56.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243472  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68117  Up in starvation  55.32 
 
 		 583 aa  55.5  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01652  C2H2 transcription factor (Seb1), putative, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09080)  40.32 
 
 		 580 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.301419 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04263  NSDC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q56UE1]  34.72 
 
 		 667 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00306213  normal  0.1267 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06503  C2H2 transcription factor (Azf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05160)  40.32 
 
 		 457 aa  53.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09025  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  41.38 
 
 		 891 aa  52.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05810  conserved hypothetical protein  41.94 
 
 		 851 aa  52.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109949  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80960  Zinc Finger Protein C2H2-like protein  36.96 
 
 		 1195 aa  52.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758804  normal  0.0450473 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02421  Putative uncharacterized proteinPutative zinc finger protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74256]  29.07 
 
 		 354 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0534008 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68294  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  38.33 
 
 		 1009 aa  51.6  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05583  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11480)  31.63 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018234  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05003  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09820)  50 
 
 		 596 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51364  protein similar to protein that controls the expression of ADH2, peroxisomal protein genes, and genes required for ethanol, glycerol, and fatty acid utilization  39.22 
 
 		 1211 aa  50.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33273  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  34.34 
 
 		 857 aa  48.9  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0974911  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05726  Putative transcription factor CrzAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B154]  33.33 
 
 		 730 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67778  ADR1-like Zn finger domain protein  40 
 
 		 1049 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.119069 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_09492  DNA binding regulatory protein AmdX [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79045]  44.44 
 
 		 1150 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100907  normal  0.703915 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00290  conserved hypothetical protein  36.51 
 
 		 815 aa  47.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04013  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04110)  41.82 
 
 		 864 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67047  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  34.38 
 
 		 781 aa  47.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.928485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67657  protein involved in methionine metabolism  35.62 
 
 		 513 aa  47.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.316751  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00973  Regulatory protein brlA (Bristle A protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10069]  42.11 
 
 		 432 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00870  RNA polymerase II transcription factor, putative  42.19 
 
 		 650 aa  47  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00600  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  31.08 
 
 		 716 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88332  DNA-binding transcription factor  38.71 
 
 		 421 aa  46.6  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11112  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  40.74 
 
 		 446 aa  46.2  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10910  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  39.06 
 
 		 913 aa  45.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401356  normal  0.142996 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42941  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  38.6 
 
 		 794 aa  45.4  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.48255  normal  0.719128 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64902  possible regulatory protein  36.73 
 
 		 675 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.459104  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06733  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05960)  31.34 
 
 		 1003 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.425426  normal  0.941684 
 
 
-
 
NC_006686  CND01440  conserved hypothetical protein  34.38 
 
 		 453 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01265  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10080)  38.6 
 
 		 627 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.180578 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04720  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  35 
 
 		 313 aa  42.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000217487  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02270  Putative uncharacterized proteinRegulatory protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00170]  40.82 
 
 		 880 aa  42  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>