31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42941 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_42941  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  100 
 
 		 794 aa  1662    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.48255  normal  0.719128 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67179  C2H2 zinc finger protein Ribonuc_L-PSP Endoribonuclease L-PSP  43.53 
 
 		 724 aa  549  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06733  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05960)  27.03 
 
 		 1003 aa  240  9e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.425426  normal  0.941684 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54178  C2H2 zinc finger protein  30.05 
 
 		 1158 aa  236  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29464  C2H2 zinc finger protein  24.95 
 
 		 712 aa  103  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11197  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  23.75 
 
 		 865 aa  93.2  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03730  conserved hypothetical protein  23.43 
 
 		 819 aa  63.9  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00486  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02070)  24.64 
 
 		 786 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05659  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13600)  39.39 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504143  normal  0.402807 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11212  C2H2 type zinc finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02360)  23.83 
 
 		 687 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05583  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11480)  34.83 
 
 		 306 aa  50.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018234  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10910  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  43.14 
 
 		 913 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401356  normal  0.142996 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07118  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  22.67 
 
 		 991 aa  48.1  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32504  transcriptional repressor  36.11 
 
 		 258 aa  47.8  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0168465 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00890  early growth response protein 1 (egr-1), putative  21.43 
 
 		 662 aa  47.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68117  Up in starvation  32.26 
 
 		 583 aa  47.8  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03070  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1161 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00390  expressed protein  40.38 
 
 		 691 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04013  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04110)  23.21 
 
 		 864 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00973  Regulatory protein brlA (Bristle A protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10069]  35 
 
 		 432 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00333  C2H2 type zinc finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02360)  20.76 
 
 		 598 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11112  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  22.47 
 
 		 446 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00550  DNA-binding protein cre-1, putative  39.29 
 
 		 737 aa  45.8  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141726  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02290  Transcription factor steA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O74252]  34.38 
 
 		 692 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243472  normal  0.712595 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_09492  DNA binding regulatory protein AmdX [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79045]  22.69 
 
 		 1150 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100907  normal  0.703915 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08735  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  39.62 
 
 		 443 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67859  transcription factor involved in glucose repression  29.21 
 
 		 579 aa  45.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03637  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  22.01 
 
 		 625 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.031235  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09025  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  19.59 
 
 		 891 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03060  C2H2 zinc finger protein Zas1A, putative  22.69 
 
 		 1078 aa  45.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08357  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00750)  33.33 
 
 		 632 aa  45.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>