65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_80960 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_80960  Zinc Finger Protein C2H2-like protein  100 
 
 
1195 aa  2447    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758804  normal  0.0450473 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_09492  DNA binding regulatory protein AmdX [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79045]  72.37 
 
 
1150 aa  122  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100907  normal  0.703915 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51364  protein similar to protein that controls the expression of ADH2, peroxisomal protein genes, and genes required for ethanol, glycerol, and fatty acid utilization  62.16 
 
 
1211 aa  107  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352495  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67778  ADR1-like Zn finger domain protein  55.36 
 
 
1049 aa  83.2  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.119069 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02270  Putative uncharacterized proteinRegulatory protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00170]  58 
 
 
880 aa  75.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.132448  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03070  hypothetical protein  44.07 
 
 
1161 aa  72  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00096  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  58.82 
 
 
993 aa  70.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01652  C2H2 transcription factor (Seb1), putative, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09080)  38.64 
 
 
580 aa  69.3  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.301419 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06195  DNA-binding protein creA (Carbon catabolite repressor) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q01981]  45.33 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000354127  normal  0.238191 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04013  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04110)  50.98 
 
 
864 aa  68.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67859  transcription factor involved in glucose repression  31.88 
 
 
579 aa  67.4  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02160  conserved hypothetical protein  46.67 
 
 
746 aa  67.4  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67047  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  45.45 
 
 
781 aa  66.6  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.928485  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02290  Transcription factor steA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O74252]  36.46 
 
 
692 aa  66.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243472  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00550  DNA-binding protein cre-1, putative  45.83 
 
 
737 aa  65.9  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141726  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03060  C2H2 zinc finger protein Zas1A, putative  33.33 
 
 
1078 aa  65.9  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09538  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16230)  21.81 
 
 
752 aa  65.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000221271  normal  0.258787 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04263  NSDC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q56UE1]  47.46 
 
 
667 aa  65.1  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00306213  normal  0.1267 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04720  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  56.52 
 
 
313 aa  64.3  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000217487  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10910  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  42.47 
 
 
913 aa  64.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401356  normal  0.142996 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68117  Up in starvation  39.13 
 
 
583 aa  63.5  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50873  ADR1-like protein  55.36 
 
 
146 aa  63.9  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07118  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  53.19 
 
 
991 aa  62.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05726  Putative transcription factor CrzAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B154]  46.15 
 
 
730 aa  62  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242002  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48819  DNA-binding protein (Carbon catabolite repressor)  46.88 
 
 
250 aa  61.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64902  possible regulatory protein  46.15 
 
 
675 aa  60.8  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.459104  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68294  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  47.17 
 
 
1009 aa  60.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11112  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  40.54 
 
 
446 aa  59.7  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05810  conserved hypothetical protein  52.38 
 
 
851 aa  59.7  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109949  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33273  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  37.97 
 
 
857 aa  58.2  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0974911  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04873  C2H2 transcription factor (Swi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11250)  44.23 
 
 
741 aa  57  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.342827 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04070  transcriptional regulator nrg2, putative  44.12 
 
 
359 aa  56.6  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67657  protein involved in methionine metabolism  33.71 
 
 
513 aa  56.2  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.316751  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00590  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  46.94 
 
 
333 aa  56.2  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01440  conserved hypothetical protein  37.97 
 
 
453 aa  55.8  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00600  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  40.3 
 
 
716 aa  55.8  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05003  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09820)  49.06 
 
 
596 aa  55.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00870  RNA polymerase II transcription factor, putative  45.83 
 
 
650 aa  54.3  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06733  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05960)  31.18 
 
 
1003 aa  54.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.425426  normal  0.941684 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67866  asparagine-rich zinc finger protein  48.15 
 
 
465 aa  53.5  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.12306 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00890  early growth response protein 1 (egr-1), putative  44.07 
 
 
662 aa  53.1  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08741  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02690)  43.64 
 
 
311 aa  53.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000382174  normal  0.0385189 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29464  C2H2 zinc finger protein  47.62 
 
 
712 aa  52  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08663  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G01910)  44 
 
 
730 aa  52  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.872321 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05966  RfeC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J177]  36.67 
 
 
519 aa  52  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.247112  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67626  zinc finger protein  33.04 
 
 
543 aa  50.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.482303  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00290  conserved hypothetical protein  42.62 
 
 
815 aa  51.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01265  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10080)  43.14 
 
 
627 aa  50.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.180578 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00973  Regulatory protein brlA (Bristle A protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10069]  33.02 
 
 
432 aa  50.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06503  C2H2 transcription factor (Azf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05160)  44.23 
 
 
457 aa  50.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.843085 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05583  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11480)  29.36 
 
 
306 aa  49.3  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018234  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32504  transcriptional repressor  39.68 
 
 
258 aa  49.3  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0168465 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80808  putative zinc finger protein  41.82 
 
 
802 aa  48.9  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.10969 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02421  Putative uncharacterized proteinPutative zinc finger protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74256]  31.17 
 
 
354 aa  48.9  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0534008 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31236  Strongly-conserved Zn-finger binding protein (TFIIIA)  41.67 
 
 
449 aa  47.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.269579  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61434  calcineurin responsive zinc-finger  34.38 
 
 
225 aa  47.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.383997 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05659  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13600)  34.67 
 
 
314 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504143  normal  0.402807 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11197  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  41.07 
 
 
865 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08735  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  43.75 
 
 
443 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04900  conserved hypothetical protein  50 
 
 
845 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.266265  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01705  conserved hypothetical protein  39.47 
 
 
521 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.25113 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54178  C2H2 zinc finger protein  27.96 
 
 
1158 aa  45.4  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01997  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10380)  36.21 
 
 
428 aa  45.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09025  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  40 
 
 
891 aa  45.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88332  DNA-binding transcription factor  38 
 
 
421 aa  44.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>