293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_35844 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_35844  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  100 
 
 
403 aa  825    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.313147  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0885  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.8 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0088343  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04050  conserved hypothetical protein  32.08 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.991162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14680  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.3 
 
 
240 aa  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3861  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.3 
 
 
240 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5255  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.88 
 
 
263 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1393  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.26 
 
 
242 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.15 
 
 
247 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1604  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.3 
 
 
239 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.547241  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2152  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.22 
 
 
238 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3590  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.22 
 
 
238 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1669  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.69 
 
 
238 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2170  putative phosphodiesterase  50.94 
 
 
240 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25400  putative phosphodiesterase  30.3 
 
 
240 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2470  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.77 
 
 
277 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1902  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.62 
 
 
240 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2333  glycerophosphodiester phosphodiesterase, cytosolic  32.67 
 
 
241 aa  59.7  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111179  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1033  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.18 
 
 
279 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0060  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.16 
 
 
240 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1345  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.48 
 
 
231 aa  59.3  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.45 
 
 
222 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2107  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  29.77 
 
 
240 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.909521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1693  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.12 
 
 
238 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4713  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  49.02 
 
 
350 aa  57.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1170  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.64 
 
 
222 aa  57  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0199  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.19 
 
 
305 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0683  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.96 
 
 
238 aa  56.6  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.56 
 
 
341 aa  56.6  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0709  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.19 
 
 
229 aa  56.6  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000121711 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0569  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.43 
 
 
227 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4047  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.94 
 
 
222 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2374  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.71 
 
 
277 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0961804  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0188  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.25 
 
 
227 aa  55.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.620509 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0440  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.35 
 
 
460 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3369  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.58 
 
 
381 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6546  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.43 
 
 
259 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.541894 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.11 
 
 
228 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6134  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.43 
 
 
259 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916586  normal  0.272485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1005  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.8 
 
 
271 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.382859  normal  0.0862396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3128  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.15 
 
 
397 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1160  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.47 
 
 
237 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2872  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46 
 
 
341 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.58 
 
 
233 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2191  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  20.49 
 
 
284 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.68 
 
 
301 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0585  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.45 
 
 
219 aa  53.9  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.815956  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2092  glycerophosphodiester phosphodiesterase  47.17 
 
 
250 aa  53.5  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.275875  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0332  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.06 
 
 
395 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02000  glycerophosphodiester phosphodiesterase, putative  30.46 
 
 
349 aa  53.5  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.695545  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0074  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48 
 
 
257 aa  53.5  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0208  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.92 
 
 
318 aa  53.1  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1464  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.94 
 
 
327 aa  53.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13160  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  30 
 
 
249 aa  53.1  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30810  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.4 
 
 
246 aa  53.1  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1811  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30 
 
 
247 aa  53.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00873752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1111  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34 
 
 
273 aa  53.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1776  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30 
 
 
247 aa  53.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000170657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0435  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.71 
 
 
263 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3673  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.81 
 
 
330 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2228  hypothetical protein  32.43 
 
 
239 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2200  hypothetical protein  32.43 
 
 
239 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 
320 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34 
 
 
242 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.59157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.14 
 
 
1372 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3150  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.74 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1266  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.39 
 
 
309 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000171875  normal  0.0938109 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1123  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.34 
 
 
252 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  41.07 
 
 
241 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0388  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.94 
 
 
308 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  41.07 
 
 
241 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0662  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.09 
 
 
304 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0956645  normal  0.017312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0112  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.83 
 
 
260 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1551  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.58 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0957  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  48 
 
 
247 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.64 
 
 
241 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  41.07 
 
 
241 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  41.07 
 
 
241 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  41.07 
 
 
241 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.65 
 
 
242 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2904  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.01 
 
 
258 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000060141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0725  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  23.2 
 
 
309 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506569 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2310  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.75 
 
 
276 aa  51.2  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  41.07 
 
 
241 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  41.07 
 
 
241 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  41.07 
 
 
241 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  42.59 
 
 
241 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2677  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.28 
 
 
594 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3339  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.49 
 
 
600 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000608256  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.62 
 
 
419 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4209  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.63 
 
 
616 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0133  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.23 
 
 
252 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5208  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30 
 
 
249 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1072  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.62 
 
 
419 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.43 
 
 
247 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300286  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18890  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.33 
 
 
266 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.231649  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0937  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.56 
 
 
257 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0996  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.63 
 
 
255 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15710  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.66 
 
 
326 aa  50.4  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.813483  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0998  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40 
 
 
257 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6042  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.87 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>