38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_37028 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_31402  predicted protein  92.73 
 
 
853 aa  966    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.354429  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38388  predicted protein  96.91 
 
 
1277 aa  1161    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553316  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34031  predicted protein  96.56 
 
 
1284 aa  1160    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40404  predicted protein  70.63 
 
 
612 aa  737    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40843  predicted protein  95.88 
 
 
903 aa  1145    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_37028  predicted protein  100 
 
 
577 aa  1192    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113495  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40608  predicted protein  86.43 
 
 
911 aa  1002    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.158773  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37227  predicted protein  97.72 
 
 
1144 aa  1153    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40612  predicted protein  59.49 
 
 
1097 aa  669    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31534  predicted protein  85.2 
 
 
332 aa  589  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000066537  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37580  predicted protein  41.91 
 
 
982 aa  411  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252616  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38156  predicted protein  40.51 
 
 
1023 aa  403  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00847311  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_52461  predicted protein  40 
 
 
979 aa  400  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000189103  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54883  predicted protein  39.66 
 
 
980 aa  394  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0342548  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41318  predicted protein  40.17 
 
 
916 aa  385  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.305609  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39762  predicted protein  38.96 
 
 
917 aa  380  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.00000929997  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45390  predicted protein  38.47 
 
 
926 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.000123588  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49118  predicted protein  38.47 
 
 
918 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00139685  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31881  predicted protein  74.1 
 
 
251 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.633922  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34728  predicted protein  39.48 
 
 
951 aa  373  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.148187  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47650  predicted protein  37.91 
 
 
1517 aa  368  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34943  predicted protein  36.03 
 
 
1005 aa  338  9.999999999999999e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00018875  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47974  predicted protein  35.09 
 
 
897 aa  277  4e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0286581  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37902  predicted protein  54.13 
 
 
841 aa  225  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0559986  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37218  predicted protein  52.05 
 
 
671 aa  212  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.00000635734  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41628  predicted protein  34.12 
 
 
352 aa  200  7e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0459535  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33639  predicted protein  34.21 
 
 
351 aa  196  7e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358412  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37220  predicted protein  35.37 
 
 
330 aa  186  8e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00536264  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31533  predicted protein  64.75 
 
 
516 aa  171  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0011992  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33638  predicted protein  52 
 
 
507 aa  158  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467627  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39510  predicted protein  34.47 
 
 
591 aa  154  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000156281  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40722  predicted protein  31.38 
 
 
313 aa  148  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000570918  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37727  predicted protein  40.49 
 
 
169 aa  110  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000946413  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37222  predicted protein  72.73 
 
 
467 aa  105  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.00000000463467  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47938  predicted protein  34.56 
 
 
149 aa  76.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.956108  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32553  predicted protein  36.36 
 
 
148 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0017296  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37402  predicted protein  38.32 
 
 
168 aa  65.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00289781  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36988  predicted protein  35.06 
 
 
101 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0113606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>