41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38388 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_40608  predicted protein  88.76 
 
 
911 aa  1628    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.158773  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_52461  predicted protein  48.42 
 
 
979 aa  848    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000189103  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54883  predicted protein  47.36 
 
 
980 aa  836    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0342548  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47974  predicted protein  57.78 
 
 
897 aa  674    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0286581  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39762  predicted protein  43.25 
 
 
917 aa  670    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.00000929997  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38388  predicted protein  100 
 
 
1277 aa  2635    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553316  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38156  predicted protein  47.7 
 
 
1023 aa  862    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00847311  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47650  predicted protein  46.14 
 
 
1517 aa  831    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37902  predicted protein  60.26 
 
 
841 aa  656    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0559986  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49118  predicted protein  47.56 
 
 
918 aa  818    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00139685  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31402  predicted protein  91.3 
 
 
853 aa  1605    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.354429  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37580  predicted protein  49.1 
 
 
982 aa  865    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252616  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40404  predicted protein  72.61 
 
 
612 aa  776    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37227  predicted protein  94.48 
 
 
1144 aa  1899    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_37028  predicted protein  96.91 
 
 
577 aa  1162    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113495  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40612  predicted protein  64.12 
 
 
1097 aa  1229    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45390  predicted protein  47.56 
 
 
926 aa  818    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.000123588  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34943  predicted protein  41.98 
 
 
1005 aa  674    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00018875  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34728  predicted protein  48.33 
 
 
951 aa  837    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.148187  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34031  predicted protein  98.79 
 
 
1284 aa  1972    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40843  predicted protein  98.44 
 
 
903 aa  1806    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41318  predicted protein  48.51 
 
 
916 aa  830    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.305609  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41578  predicted protein  95.97 
 
 
391 aa  697    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0705581  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31533  predicted protein  63.6 
 
 
516 aa  670    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0011992  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37218  predicted protein  57.27 
 
 
671 aa  631  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.00000635734  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31534  predicted protein  88.82 
 
 
332 aa  626  1e-178  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000066537  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33638  predicted protein  54.65 
 
 
507 aa  518  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467627  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37222  predicted protein  56.86 
 
 
467 aa  459  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.00000000463467  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31881  predicted protein  77.29 
 
 
251 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.633922  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37726  predicted protein  57.95 
 
 
342 aa  398  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000639291  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39510  predicted protein  62.05 
 
 
591 aa  375  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000156281  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41628  predicted protein  34.71 
 
 
352 aa  213  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0459535  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32340  predicted protein  68.66 
 
 
163 aa  213  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000766504  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33639  predicted protein  35.29 
 
 
351 aa  209  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358412  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37220  predicted protein  34.12 
 
 
330 aa  190  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00536264  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40722  predicted protein  32 
 
 
313 aa  159  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000570918  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37727  predicted protein  41.72 
 
 
169 aa  122  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000946413  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47938  predicted protein  35.29 
 
 
149 aa  87.8  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.956108  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32553  predicted protein  38.64 
 
 
148 aa  80.9  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0017296  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37402  predicted protein  37.38 
 
 
168 aa  63.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00289781  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36988  predicted protein  34.04 
 
 
101 aa  52.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0113606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>