More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_53878 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_53878  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 601 aa  1249    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17428  predicted protein  44.72 
 
 		 590 aa  511  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.006002  normal  0.594613 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_56512  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  44 
 
 		 786 aa  466  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  41.11 
 
 		 553 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  41.28 
 
 		 649 aa  405  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  41.38 
 
 		 549 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  41.11 
 
 		 543 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4714  glucose-6-phosphate isomerase  40.43 
 
 		 554 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4334  glucose-6-phosphate isomerase  40.25 
 
 		 554 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4420  glucose-6-phosphate isomerase  40.25 
 
 		 554 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10963  glucose-6-phosphate isomerase  39.72 
 
 		 553 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05060  glucose-6-phosphate isomerase  41.73 
 
 		 552 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  40.14 
 
 		 543 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3338  Glucose-6-phosphate isomerase  41.53 
 
 		 554 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1318  glucose-6-phosphate isomerase  42.15 
 
 		 568 aa  387  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.321309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1334  Glucose-6-phosphate isomerase  40.83 
 
 		 565 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.994679  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0343  glucose-6-phosphate isomerase  40.71 
 
 		 564 aa  386  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  41.54 
 
 		 546 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  41.27 
 
 		 569 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  42.23 
 
 		 546 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0370  Glucose-6-phosphate isomerase  39.19 
 
 		 561 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11040  glucose-6-phosphate isomerase  42.42 
 
 		 564 aa  382  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0493698  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  39.93 
 
 		 556 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1311  Glucose-6-phosphate isomerase  41.81 
 
 		 560 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15279  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  40.88 
 
 		 543 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  38.88 
 
 		 548 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  39.04 
 
 		 556 aa  373  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0469  glucose-6-phosphate isomerase  40.21 
 
 		 546 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  40.66 
 
 		 550 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1025  glucose-6-phosphate isomerase  37.09 
 
 		 566 aa  373  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7561  glucose-6-phosphate isomerase  40.31 
 
 		 545 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1463  glucose-6-phosphate isomerase  40.38 
 
 		 561 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  39.47 
 
 		 531 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  36.82 
 
 		 567 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  37.83 
 
 		 540 aa  364  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  36.58 
 
 		 546 aa  363  4e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  37.24 
 
 		 541 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  38 
 
 		 549 aa  362  8e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  39.47 
 
 		 548 aa  362  9e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0183  Glucose-6-phosphate isomerase  38.94 
 
 		 571 aa  362  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  37.21 
 
 		 547 aa  359  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  37.16 
 
 		 547 aa  358  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  38.91 
 
 		 549 aa  356  5.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7286  glucose-6-phosphate isomerase  41.37 
 
 		 570 aa  355  8.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813116  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  36.9 
 
 		 549 aa  356  8.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  37.03 
 
 		 559 aa  355  8.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  39.64 
 
 		 540 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  38.24 
 
 		 545 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  36.78 
 
 		 556 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  36.78 
 
 		 556 aa  355  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  36.78 
 
 		 556 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  37.66 
 
 		 548 aa  353  4e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  38.78 
 
 		 540 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  36.67 
 
 		 556 aa  353  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  40.15 
 
 		 547 aa  353  7e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  37.59 
 
 		 540 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  37.41 
 
 		 540 aa  351  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  37.41 
 
 		 540 aa  351  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  39.58 
 
 		 542 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  37.41 
 
 		 540 aa  351  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  37.41 
 
 		 540 aa  351  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  36.96 
 
 		 540 aa  350  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  38.16 
 
 		 548 aa  350  5e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  36.81 
 
 		 615 aa  350  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  38.09 
 
 		 562 aa  350  5e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  37.18 
 
 		 540 aa  350  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  37.24 
 
 		 540 aa  350  6e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  37.34 
 
 		 547 aa  349  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  38.33 
 
 		 560 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  37.24 
 
 		 540 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  39.89 
 
 		 570 aa  348  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  37.66 
 
 		 539 aa  347  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  37.38 
 
 		 545 aa  347  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  37.12 
 
 		 548 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  37.66 
 
 		 539 aa  347  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  37.89 
 
 		 550 aa  347  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  36.29 
 
 		 552 aa  347  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  38.65 
 
 		 547 aa  346  6e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2030  Glucose-6-phosphate isomerase  39.7 
 
 		 550 aa  345  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  37.9 
 
 		 539 aa  345  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  38.66 
 
 		 540 aa  343  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  38.76 
 
 		 545 aa  343  5e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  38.73 
 
 		 549 aa  342  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  39.29 
 
 		 549 aa  342  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  39.29 
 
 		 549 aa  342  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  39.5 
 
 		 550 aa  341  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  38.37 
 
 		 551 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  36.27 
 
 		 552 aa  340  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  37.34 
 
 		 549 aa  340  5.9999999999999996e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  37.43 
 
 		 545 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  36.86 
 
 		 550 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1719  glucose-6-phosphate isomerase  37.02 
 
 		 539 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  36.69 
 
 		 550 aa  337  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  37.45 
 
 		 545 aa  337  5e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1849  glucose-6-phosphate isomerase  35.95 
 
 		 546 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  37.65 
 
 		 550 aa  336  5.999999999999999e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  38.42 
 
 		 541 aa  336  7e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  34.93 
 
 		 548 aa  336  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  37.59 
 
 		 554 aa  336  9e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  37.03 
 
 		 545 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>