More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50081 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_50081  predicted protein  100 
 
 
569 aa  1171    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50296  predicted protein  36.95 
 
 
528 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.667552  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06996  ubiquinone biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04590)  26.51 
 
 
685 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0373045  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52708  predicted protein  27.85 
 
 
647 aa  181  4.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16803  predicted protein  27.66 
 
 
428 aa  169  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14688  predicted protein  28.98 
 
 
402 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43325  predicted protein  28.92 
 
 
532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456138  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04150  mitochondrion protein, putative  27.1 
 
 
1149 aa  159  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36156  predicted protein  28.44 
 
 
426 aa  157  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.838478  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  31.54 
 
 
565 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  26.74 
 
 
562 aa  136  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  28.46 
 
 
557 aa  134  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  26.42 
 
 
568 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  27.56 
 
 
564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  32.09 
 
 
552 aa  131  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  27.2 
 
 
558 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.51 
 
 
559 aa  130  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  26.57 
 
 
666 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  27.32 
 
 
560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  26.43 
 
 
560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  27.2 
 
 
550 aa  129  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  27.09 
 
 
549 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.71 
 
 
522 aa  128  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.56 
 
 
525 aa  127  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  27.59 
 
 
544 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  27.09 
 
 
544 aa  126  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3761  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.11 
 
 
545 aa  126  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  26.84 
 
 
549 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.65 
 
 
558 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03728  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.13 
 
 
546 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4144  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.13 
 
 
546 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4356  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.13 
 
 
546 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03488  predicted protein kinase  26.04 
 
 
529 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  26.26 
 
 
563 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4307  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.13 
 
 
546 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4173  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.13 
 
 
546 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514072 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4218  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.13 
 
 
546 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118244 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03677  hypothetical protein  25.13 
 
 
546 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4059  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.13 
 
 
546 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5276  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.13 
 
 
546 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709941  normal  0.225701 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  26.23 
 
 
559 aa  125  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  25.51 
 
 
547 aa  125  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  26.8 
 
 
689 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  27.45 
 
 
565 aa  124  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  27.11 
 
 
571 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4252  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.35 
 
 
546 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4203  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.35 
 
 
546 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4180  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.35 
 
 
546 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.944164  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.61 
 
 
546 aa  123  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4299  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.35 
 
 
546 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.128892  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4359  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.35 
 
 
546 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  25.38 
 
 
559 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  26.82 
 
 
558 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2256  ABC-1 domain protein  26.05 
 
 
560 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398282 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.28 
 
 
559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  25.39 
 
 
540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  26.39 
 
 
551 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3913  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.39 
 
 
545 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.59 
 
 
549 aa  121  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.74 
 
 
559 aa  121  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3296  hypothetical protein  27.79 
 
 
684 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.42 
 
 
525 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4245  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.02 
 
 
546 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806176  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.42 
 
 
525 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4054  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.28 
 
 
546 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.09 
 
 
584 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3134  aminotransferase class-III  30.77 
 
 
875 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1806  putative protein kinase:ABC1 family  25.64 
 
 
618 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.84 
 
 
544 aa  120  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2052  ABC-1 domain protein  30.99 
 
 
570 aa  120  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000299462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  25.38 
 
 
561 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  30.85 
 
 
552 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3680  ABC-1 domain protein  25.8 
 
 
670 aa  120  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  25.64 
 
 
619 aa  120  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.62 
 
 
525 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  27.08 
 
 
619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19041  hypothetical protein  25.38 
 
 
618 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.69 
 
 
561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.43 
 
 
549 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.26 
 
 
521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.51 
 
 
540 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  26.15 
 
 
560 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  27.08 
 
 
619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.37 
 
 
525 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  26.07 
 
 
549 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  25.82 
 
 
556 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  25.89 
 
 
561 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.17 
 
 
525 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19231  hypothetical protein  25.13 
 
 
618 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.494256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  26.02 
 
 
581 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2194  hypothetical protein  24.48 
 
 
441 aa  117  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0378977  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  25.84 
 
 
547 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  24.67 
 
 
659 aa  117  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0525  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.19 
 
 
549 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2319  protein kinase  25.91 
 
 
620 aa  117  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.919005  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  26.65 
 
 
582 aa  117  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  25.48 
 
 
591 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.05 
 
 
553 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.98 
 
 
559 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.74 
 
 
543 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>