More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52708 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_52708  predicted protein  100 
 
 
647 aa  1332    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06996  ubiquinone biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04590)  47.18 
 
 
685 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0373045  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04150  mitochondrion protein, putative  39.62 
 
 
1149 aa  384  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16803  predicted protein  36.31 
 
 
428 aa  241  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14688  predicted protein  25.52 
 
 
402 aa  192  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36156  predicted protein  28.24 
 
 
426 aa  192  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.838478  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43325  predicted protein  27.69 
 
 
532 aa  187  8e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456138  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50081  predicted protein  27.85 
 
 
569 aa  181  4.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50296  predicted protein  26.67 
 
 
528 aa  150  9e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.667552  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  25.64 
 
 
544 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4218  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.58 
 
 
546 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03728  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.58 
 
 
546 aa  137  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4144  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.58 
 
 
546 aa  137  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4307  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.58 
 
 
546 aa  137  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5276  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.58 
 
 
546 aa  137  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709941  normal  0.225701 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4059  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.58 
 
 
546 aa  137  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03677  hypothetical protein  24.58 
 
 
546 aa  137  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4356  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.58 
 
 
546 aa  137  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4173  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.58 
 
 
546 aa  137  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  23.4 
 
 
546 aa  135  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25 
 
 
544 aa  135  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4211  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.09 
 
 
544 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  24.09 
 
 
558 aa  134  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4252  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.02 
 
 
546 aa  134  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4203  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.02 
 
 
546 aa  134  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4359  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.02 
 
 
546 aa  134  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4180  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.02 
 
 
546 aa  134  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.944164  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4299  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.02 
 
 
546 aa  134  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.128892  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0296  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.42 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877142  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07760  predicted unusual protein kinase  23.98 
 
 
614 aa  131  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.228217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.96 
 
 
509 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0544  2-octaprenylphenol hydroxylase  25.48 
 
 
544 aa  130  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3727  2-octaprenylphenol hydroxylase  25.38 
 
 
549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  23.87 
 
 
546 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  23.88 
 
 
549 aa  128  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4054  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  23.66 
 
 
546 aa  128  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0250  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  23.93 
 
 
543 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.28 
 
 
506 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4245  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  23.44 
 
 
546 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806176  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.73 
 
 
517 aa  128  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  23.92 
 
 
558 aa  127  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4201  ubiquinone biosynthesis protein AarF  26.18 
 
 
549 aa  127  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.59 
 
 
521 aa  127  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0459359  normal  0.0103922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.09 
 
 
544 aa  127  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0403  2-octaprenylphenol hydroxylase  24.95 
 
 
549 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.977603  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3020  ABC-1 domain protein  24.09 
 
 
574 aa  127  9e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.52 
 
 
543 aa  126  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  23.98 
 
 
564 aa  126  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.95 
 
 
553 aa  126  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.14 
 
 
558 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  25.54 
 
 
544 aa  125  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3553  2-octaprenylphenol hydroxylase  25.32 
 
 
549 aa  125  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.96851  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  23.69 
 
 
549 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  24.79 
 
 
544 aa  124  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.05 
 
 
517 aa  124  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.73 
 
 
549 aa  124  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.73 
 
 
549 aa  124  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03488  predicted protein kinase  23.76 
 
 
529 aa  123  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.73 
 
 
549 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.73 
 
 
549 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  29.72 
 
 
558 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.05 
 
 
547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1190  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.84 
 
 
552 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.601295  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3913  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  23.44 
 
 
545 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  22.58 
 
 
540 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1098  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.2 
 
 
552 aa  121  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.43 
 
 
525 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.59 
 
 
521 aa  121  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.43 
 
 
525 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.43 
 
 
525 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.43 
 
 
525 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.43 
 
 
525 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.75 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.43 
 
 
525 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.43 
 
 
525 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  23.2 
 
 
533 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0504  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.3 
 
 
549 aa  118  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  23.53 
 
 
551 aa  118  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.41 
 
 
555 aa  118  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.16 
 
 
525 aa  118  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  24.35 
 
 
559 aa  118  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  23.29 
 
 
533 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  22.62 
 
 
568 aa  117  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1599  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.76 
 
 
528 aa  117  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1894  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.35 
 
 
528 aa  117  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  23.37 
 
 
534 aa  117  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  22.81 
 
 
561 aa  117  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0870  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.37 
 
 
521 aa  117  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216871  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.5 
 
 
521 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0799  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.37 
 
 
521 aa  117  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  22.51 
 
 
537 aa  117  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.12 
 
 
522 aa  117  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  24.39 
 
 
582 aa  117  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3204  ubiquinone biosynthesis protein AarF  25.69 
 
 
549 aa  117  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.95 
 
 
546 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3641  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.59 
 
 
522 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.302348  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  24.9 
 
 
581 aa  117  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.15 
 
 
549 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3943  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  23.01 
 
 
543 aa  117  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  24.69 
 
 
581 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>