More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50296 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_50296  predicted protein  100 
 
 		 528 aa  1100    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.667552  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50081  predicted protein  36.95 
 
 		 569 aa  251  3e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16803  predicted protein  30.56 
 
 		 428 aa  181  4e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52708  predicted protein  26.67 
 
 		 647 aa  166  6.9999999999999995e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43325  predicted protein  25.48 
 
 		 532 aa  150  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456138  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06996  ubiquinone biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04590)  25.97 
 
 		 685 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0373045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36156  predicted protein  28.5 
 
 		 426 aa  144  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.838478  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14688  predicted protein  27.12 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04150  mitochondrion protein, putative  25.38 
 
 		 1149 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.4 
 
 		 554 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.1 
 
 		 559 aa  124  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0544  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.68 
 
 		 544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  25.71 
 
 		 563 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.89 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  26.11 
 
 		 558 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.82 
 
 		 559 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  27.18 
 
 		 559 aa  118  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.25 
 
 		 592 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  25.12 
 
 		 561 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  26.6 
 
 		 549 aa  115  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2194  hypothetical protein  25.69 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0378977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.74 
 
 		 511 aa  114  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.61 
 
 		 584 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  26.3 
 
 		 557 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0379  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.27 
 
 		 522 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  26.01 
 
 		 566 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.34 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.49 
 
 		 555 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  28.02 
 
 		 560 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4299  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.17 
 
 		 546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.128892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4180  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.17 
 
 		 546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.944164  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  26.11 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4203  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.17 
 
 		 546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  31.6 
 
 		 552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4252  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.17 
 
 		 546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.13 
 
 		 504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0082  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.63 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.55 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4359  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.17 
 
 		 546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  25.37 
 
 		 561 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0210  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.64 
 
 		 524 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.59 
 
 		 546 aa  111  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  26.18 
 
 		 557 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.96 
 
 		 521 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3761  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.69 
 
 		 545 aa  110  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.38 
 
 		 524 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0085  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.4 
 
 		 525 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0602  hypothetical protein  26.17 
 
 		 436 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03488  predicted protein kinase  25.27 
 
 		 529 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.19 
 
 		 534 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  24.57 
 
 		 530 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.72 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.89 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  24.39 
 
 		 561 aa  109  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1294  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.78 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0881794  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0050  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.3 
 
 		 518 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725319  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.03 
 
 		 549 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4366  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.62 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.72 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2120  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase accessory protein  27.89 
 
 		 541 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.191993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0621  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.42 
 
 		 524 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0569858  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2681  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.98 
 
 		 539 aa  108  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  24.71 
 
 		 582 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.17 
 
 		 509 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0556  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.07 
 
 		 525 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.43 
 
 		 525 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  25.12 
 
 		 522 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.13 
 
 		 558 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  25 
 
 		 581 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4090  2-octaprenylphenol hydroxylase  24.08 
 
 		 524 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0171499  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0065  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.21 
 
 		 541 aa  107  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  24.94 
 
 		 583 aa  107  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4218  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  23.83 
 
 		 546 aa  107  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118244 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  25.68 
 
 		 564 aa  107  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03728  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  23.93 
 
 		 546 aa  106  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4144  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  23.93 
 
 		 546 aa  106  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4307  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  23.93 
 
 		 546 aa  106  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5276  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  23.93 
 
 		 546 aa  106  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709941  normal  0.225701 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  25 
 
 		 581 aa  106  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4059  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  23.93 
 
 		 546 aa  106  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03677  hypothetical protein  23.93 
 
 		 546 aa  106  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4173  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  23.93 
 
 		 546 aa  106  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514072 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4356  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  23.93 
 
 		 546 aa  106  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4211  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  24.64 
 
 		 544 aa  106  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  24.75 
 
 		 543 aa  106  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0686  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.21 
 
 		 525 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  26.38 
 
 		 562 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  21.98 
 
 		 558 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0189  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.21 
 
 		 525 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0848  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.21 
 
 		 525 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.120118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.98 
 
 		 525 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0670  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.21 
 
 		 525 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  26.85 
 
 		 521 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0459359  normal  0.0103922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.54 
 
 		 522 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2757  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.21 
 
 		 525 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.925826  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2401  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.21 
 
 		 525 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.21 
 
 		 525 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0042  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.5 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  23.66 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  25.83 
 
 		 582 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>