26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47247 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47247  predicted protein  100 
 
 		 467 aa  961    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000828474  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  27.21 
 
 		 311 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  27.22 
 
 		 262 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  34.57 
 
 		 258 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15982  predicted protein  29.55 
 
 		 332 aa  50.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283158  normal  0.0285818 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0502  hypothetical protein  26.19 
 
 		 258 aa  50.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  25.95 
 
 		 261 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  25.95 
 
 		 251 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  25.67 
 
 		 256 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  27.33 
 
 		 251 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  26.54 
 
 		 249 aa  47.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  25.47 
 
 		 251 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  21.74 
 
 		 261 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  26.09 
 
 		 253 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  25.95 
 
 		 307 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  25.9 
 
 		 255 aa  44.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  23.76 
 
 		 251 aa  44.7  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  22.78 
 
 		 247 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  25.47 
 
 		 253 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  22.16 
 
 		 334 aa  43.5  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  24.18 
 
 		 309 aa  43.5  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  25.64 
 
 		 259 aa  43.5  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  22.78 
 
 		 247 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  22.78 
 
 		 247 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  21.49 
 
 		 247 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  24.58 
 
 		 253 aa  43.1  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>