16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45154 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45154  predicted protein  100 
 
 
1055 aa  2165    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45249  predicted protein  24.46 
 
 
1421 aa  113  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49176  predicted protein  31.35 
 
 
869 aa  92.8  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.450709  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49589  predicted protein  32.47 
 
 
332 aa  80.9  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.966771  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37861  predicted protein  27.24 
 
 
373 aa  79.7  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49160  predicted protein  28.92 
 
 
261 aa  77.8  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48422  predicted protein  28.74 
 
 
702 aa  77  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28464  predicted protein  27.31 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167992  hitchhiker  0.00580538 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47047  predicted protein  23.95 
 
 
1325 aa  72  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45159  predicted protein  26.72 
 
 
683 aa  58.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0183197  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29174  predicted protein  26.38 
 
 
544 aa  56.6  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03500  beta-catenin, putative  24.39 
 
 
660 aa  54.3  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00903794  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_12408  VAC8 (JCVI)  27.81 
 
 
579 aa  52  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67974  Importin alpha subunit (Karyopherin alpha subunit) (Serine-rich RNA polymerase I suppressor protein)  24.66 
 
 
544 aa  50.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74520  vacuole memebrane protein required for vacuole inheritance  25.4 
 
 
561 aa  49.7  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49243  predicted protein  20.4 
 
 
576 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>