13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49176 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_49176  predicted protein  100 
 
 
869 aa  1753    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.450709  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49160  predicted protein  34.67 
 
 
261 aa  103  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45154  predicted protein  31.35 
 
 
1055 aa  92.8  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48422  predicted protein  30.82 
 
 
702 aa  72.4  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49589  predicted protein  33.33 
 
 
332 aa  67  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.966771  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45249  predicted protein  26.64 
 
 
1421 aa  65.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37861  predicted protein  29.17 
 
 
373 aa  60.1  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49243  predicted protein  29 
 
 
576 aa  59.3  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312572  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45159  predicted protein  26.56 
 
 
683 aa  52  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0183197  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28464  predicted protein  24.85 
 
 
292 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167992  hitchhiker  0.00580538 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74520  vacuole memebrane protein required for vacuole inheritance  30.23 
 
 
561 aa  46.6  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48333  predicted protein  33.8 
 
 
133 aa  45.8  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03500  beta-catenin, putative  30.6 
 
 
660 aa  45.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00903794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>