15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_74520 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_12408  VAC8 (JCVI)  63.26 
 
 
579 aa  693    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03500  beta-catenin, putative  60.46 
 
 
660 aa  676    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00903794  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74520  vacuole memebrane protein required for vacuole inheritance  100 
 
 
561 aa  1133    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02142  Karyopherin alphaPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X175]  25.98 
 
 
553 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.613304  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27814  predicted protein  27.73 
 
 
1546 aa  66.6  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.208046  normal  0.12178 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67974  Importin alpha subunit (Karyopherin alpha subunit) (Serine-rich RNA polymerase I suppressor protein)  26.18 
 
 
544 aa  65.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29174  predicted protein  27.86 
 
 
544 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45249  predicted protein  27.3 
 
 
1421 aa  58.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42512  predicted protein  23.86 
 
 
1096 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  27.47 
 
 
1094 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45154  predicted protein  25.4 
 
 
1055 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49176  predicted protein  30.23 
 
 
869 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.450709  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04770  Importin alpha subunit, putative  23.92 
 
 
536 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48623  predicted protein  28.12 
 
 
645 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  21.31 
 
 
408 aa  44.3  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>