15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67974 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02142  Karyopherin alphaPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X175]  58.55 
 
 
553 aa  650    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.613304  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67974  Importin alpha subunit (Karyopherin alpha subunit) (Serine-rich RNA polymerase I suppressor protein)  100 
 
 
544 aa  1133    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04770  Importin alpha subunit, putative  59 
 
 
536 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29174  predicted protein  50.09 
 
 
544 aa  490  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46552  predicted protein  50.38 
 
 
525 aa  486  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105236  normal  0.308215 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22319  predicted protein  33.69 
 
 
577 aa  261  3e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1457  predicted protein  37.89 
 
 
313 aa  175  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_5467  predicted protein  42.27 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000081806  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74520  vacuole memebrane protein required for vacuole inheritance  26.1 
 
 
561 aa  65.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27814  predicted protein  27.69 
 
 
1546 aa  60.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.208046  normal  0.12178 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_12408  VAC8 (JCVI)  24.16 
 
 
579 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03500  beta-catenin, putative  22.46 
 
 
660 aa  53.5  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00903794  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45154  predicted protein  24.66 
 
 
1055 aa  50.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  21.81 
 
 
1148 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  23.42 
 
 
1094 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>