16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_46552 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009363  OSTLU_46552  predicted protein  100 
 
 
525 aa  1082    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105236  normal  0.308215 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29174  predicted protein  60.78 
 
 
544 aa  627  1e-178  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02142  Karyopherin alphaPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X175]  57.28 
 
 
553 aa  563  1.0000000000000001e-159  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.613304  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04770  Importin alpha subunit, putative  55.6 
 
 
536 aa  551  1e-155  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67974  Importin alpha subunit (Karyopherin alpha subunit) (Serine-rich RNA polymerase I suppressor protein)  50.38 
 
 
544 aa  516  1.0000000000000001e-145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22319  predicted protein  35.41 
 
 
577 aa  312  7.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1457  predicted protein  40.68 
 
 
313 aa  197  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_5467  predicted protein  43.23 
 
 
190 aa  149  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000081806  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_12408  VAC8 (JCVI)  24.29 
 
 
579 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03500  beta-catenin, putative  24.2 
 
 
660 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00903794  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01746  ubiquitin-protein ligase Ufd4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08880)  23.72 
 
 
1820 aa  54.7  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0719286  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  24.85 
 
 
1148 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74520  vacuole memebrane protein required for vacuole inheritance  22.73 
 
 
561 aa  52  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  22.74 
 
 
1094 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  22.91 
 
 
493 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1010  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.55 
 
 
269 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>